Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
rdfs:seeAlso
| |
Description
| - Tento nástroj předpovídá efekt aminokyselinových substitucí na funkci proteinů. Jeho predikce jsou založeny na kombinaci výsledků existujících metod (MAPP, PhD-SNP, PolyPhen-1, PolyPhen-2, SIFT a SNAP), přičemž tyto metody v objektivních testech významně překonává. Metodika tvorby konsenzu je popsaná v článku: %22Bendl et. al. (2014) PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations. PLoS Computational Biology, 10%22. Uživatelské rozhraní bástroje ukazuje nejen výsledky integrovaných nástrojů a vyvinutého meta-klasifikátoru, ale také nalezené experimentální anotace těchto mutací z databází PMD a UniProt. Nástroj je zdarma dostupný akademické komunitě na adrese http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp.
- Tento nástroj předpovídá efekt aminokyselinových substitucí na funkci proteinů. Jeho predikce jsou založeny na kombinaci výsledků existujících metod (MAPP, PhD-SNP, PolyPhen-1, PolyPhen-2, SIFT a SNAP), přičemž tyto metody v objektivních testech významně překonává. Metodika tvorby konsenzu je popsaná v článku: %22Bendl et. al. (2014) PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations. PLoS Computational Biology, 10%22. Uživatelské rozhraní bástroje ukazuje nejen výsledky integrovaných nástrojů a vyvinutého meta-klasifikátoru, ale také nalezené experimentální anotace těchto mutací z databází PMD a UniProt. Nástroj je zdarma dostupný akademické komunitě na adrese http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp. (cs)
- This tool predicts the effect of amino acid substitutions on the protein function. (en)
|
Title
| - PredictSNP 1.0
- PredictSNP 1.0 (cs)
- PredictSNP1.0 (en)
|
skos:prefLabel
| - PredictSNP 1.0
- PredictSNP 1.0 (cs)
- PredictSNP1.0 (en)
|
skos:notation
| - RIV/00216224:14310/13:00065836!RIV14-AV0-14310___
|
http://linked.open...avai/predkladatel
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
http://linked.open...onomickeParametry
| - Nástroj je zdarma dostupný akademické komunitě na ad ese http://loschmidt.chemi.muni.cz/predict np. Nelze použít pro komerční účely (z důvodu ochrany práv třetích stran - několika integrovaných metod s nesvobodnou licencí).
|
http://linked.open...titaPredkladatele
| |
http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/00216224:14310/13:00065836
|
http://linked.open...terniIdentifikace
| |
http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - sw; protein function (en)
|
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
http://linked.open...echnickeParametry
| - Tento nástroj předpovídá efekt aminokyselinových substitucí na funkci proteinů. Zdrojové kódy jádra konsenzuální funkce tvořící klíčovou, nicméně z hlediska velikosti kódu minoritní část projektu, jsou dostupné na adrese: http://ll47.sci.muni.cz:6212/predictsnp/predictsnp-1.0.tar.gz
|
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Brezovský, Jan
- Damborský, Jiří
- Pavelka, Antonín
- Zendulka, J.
- Bendl, Jaroslav
- Salanda, O.
- Wieben, E. D.
- Štourač, Jan
|
http://linked.open...avai/riv/vlastnik
| |
http://linked.open...itiJinymSubjektem
| |
http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |