About: PredictSNP 1.0     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Tento nástroj předpovídá efekt aminokyselinových substitucí na funkci proteinů. Jeho predikce jsou založeny na kombinaci výsledků existujících metod (MAPP, PhD-SNP, PolyPhen-1, PolyPhen-2, SIFT a SNAP), přičemž tyto metody v objektivních testech významně překonává. Metodika tvorby konsenzu je popsaná v článku: %22Bendl et. al. (2014) PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations. PLoS Computational Biology, 10%22. Uživatelské rozhraní bástroje ukazuje nejen výsledky integrovaných nástrojů a vyvinutého meta-klasifikátoru, ale také nalezené experimentální anotace těchto mutací z databází PMD a UniProt. Nástroj je zdarma dostupný akademické komunitě na adrese http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp.
  • Tento nástroj předpovídá efekt aminokyselinových substitucí na funkci proteinů. Jeho predikce jsou založeny na kombinaci výsledků existujících metod (MAPP, PhD-SNP, PolyPhen-1, PolyPhen-2, SIFT a SNAP), přičemž tyto metody v objektivních testech významně překonává. Metodika tvorby konsenzu je popsaná v článku: %22Bendl et. al. (2014) PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations. PLoS Computational Biology, 10%22. Uživatelské rozhraní bástroje ukazuje nejen výsledky integrovaných nástrojů a vyvinutého meta-klasifikátoru, ale také nalezené experimentální anotace těchto mutací z databází PMD a UniProt. Nástroj je zdarma dostupný akademické komunitě na adrese http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp. (cs)
  • This tool predicts the effect of amino acid substitutions on the protein function. (en)
Title
  • PredictSNP 1.0
  • PredictSNP 1.0 (cs)
  • PredictSNP1.0 (en)
skos:prefLabel
  • PredictSNP 1.0
  • PredictSNP 1.0 (cs)
  • PredictSNP1.0 (en)
skos:notation
  • RIV/00216224:14310/13:00065836!RIV14-AV0-14310___
http://linked.open...avai/predkladatel
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(IAA401630901)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...onomickeParametry
  • Nástroj je zdarma dostupný akademické komunitě na ad ese http://loschmidt.chemi.muni.cz/predict np. Nelze použít pro komerční účely (z důvodu ochrany práv třetích stran - několika integrovaných metod s nesvobodnou licencí).
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 98633
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/00216224:14310/13:00065836
http://linked.open...terniIdentifikace
  • PredictSNP 1.0
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • sw; protein function (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [632871A56727]
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...echnickeParametry
  • Tento nástroj předpovídá efekt aminokyselinových substitucí na funkci proteinů. Zdrojové kódy jádra konsenzuální funkce tvořící klíčovou, nicméně z hlediska velikosti kódu minoritní část projektu, jsou dostupné na adrese: http://ll47.sci.muni.cz:6212/predictsnp/predictsnp-1.0.tar.gz
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Brezovský, Jan
  • Damborský, Jiří
  • Pavelka, Antonín
  • Zendulka, J.
  • Bendl, Jaroslav
  • Salanda, O.
  • Wieben, E. D.
  • Štourač, Jan
http://linked.open...avai/riv/vlastnik
http://linked.open...itiJinymSubjektem
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 14310
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software