About: Detection of prophages in Staphylococcus aureus strains using multiplex PCR

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Detection of prophages in Staphylococcus aureus strains using multiplex PCR Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
Description	neuvedeno (en) V genomech typizačních fágů S. aureus mezinárodní řady byly vyhledány sekvence specific-ké pro fágové druhy séroskupin A (fág 3A, 5 003 bp), B (fág 53, 3 926 bp), F (fág 77, 3 398 bp) a L (fág 187, 1 927 bp). Hybridizační sondy připravené z těchto sekvencí detekují v lyzogenních kmenench S. aureus profágy příslušných fágových druhů. K usnadnění detekce profágů byly pro každou ze specifických sond stanoveny sekvence a navrženy PCR-primery, umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti (pro fágy serologické skupiny A: 3A-F 5' CTT TGA CAT GAC ATC CGC TTG AC 3' a 3A-R 5' TAT CAG GCG AGA ATT AAG GG 3', produkt 745 bp; pro fágy serologické skupiny B: 53-F 5' ACT TAT CCA GGT GGY GTT ATT G 3' a 53-R 5' TGT ATT TAA TTT CGC CGT TAG TG 3', produkt 405 bp; pro fágy serologické skupiny F: 77-F 5' TAC GGG AAA ATA TTC GGA AG 3' a 77-R 5' ATA ATC CGC ACC TCA TTC CT 3', produkt 548 bp a pro fágy serologické skupiny L produkt 850 bp). Optimalizací sady primerů byla zavedena mul V genomech typizačních fágů S. aureus mezinárodní řady byly vyhledány sekvence specific-ké pro fágové druhy séroskupin A (fág 3A, 5 003 bp), B (fág 53, 3 926 bp), F (fág 77, 3 398 bp) a L (fág 187, 1 927 bp). Hybridizační sondy připravené z těchto sekvencí detekují v lyzogenních kmenench S. aureus profágy příslušných fágových druhů. K usnadnění detekce profágů byly pro každou ze specifických sond stanoveny sekvence a navrženy PCR-primery, umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti (pro fágy serologické skupiny A: 3A-F 5' CTT TGA CAT GAC ATC CGC TTG AC 3' a 3A-R 5' TAT CAG GCG AGA ATT AAG GG 3', produkt 745 bp; pro fágy serologické skupiny B: 53-F 5' ACT TAT CCA GGT GGY GTT ATT G 3' a 53-R 5' TGT ATT TAA TTT CGC CGT TAG TG 3', produkt 405 bp; pro fágy serologické skupiny F: 77-F 5' TAC GGG AAA ATA TTC GGA AG 3' a 77-R 5' ATA ATC CGC ACC TCA TTC CT 3', produkt 548 bp a pro fágy serologické skupiny L produkt 850 bp). Optimalizací sady primerů byla zavedena mul (cs)
Title	Detection of prophages in Staphylococcus aureus strains using multiplex PCR (en) Detekce profágů v kmenech <I>Staphylococcus aureus</I> pomocí multiplex PCR Detekce profágů v kmenech <I>Staphylococcus aureus</I> pomocí multiplex PCR (cs)
skos:prefLabel	Detection of prophages in Staphylococcus aureus strains using multiplex PCR (en) Detekce profágů v kmenech <I>Staphylococcus aureus</I> pomocí multiplex PCR Detekce profágů v kmenech <I>Staphylococcus aureus</I> pomocí multiplex PCR (cs)
skos:notation	RIV/00216224:14310/02:00006635!RIV08-MSM-14310___
http://linked.open.../vavai/riv/strany	37
http://linked.open...avai/riv/aktivita	P Z
http://linked.open...avai/riv/aktivity	P(GA301/02/1505), Z(MSM 143100008)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika	1
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2008
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Kvardová, Veronika Oráčová, Eva Doškař, Jiří Pantůček, Roman
http://linked.open.../riv/druhVysledku	J - Článek v odborném periodiku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...dnocenehoVysledku	642672
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/00216224:14310/02:00006635
http://linked.open...riv/jazykVysledku	cze - čeština
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	Bacterial Typing Techniques; DNA; Bacteriophages; Staphylococcus aureus; Lysogeny; Multiplex PCR; Prophage detection (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	Multiplex PCR DNA Staphylococcus aureus Lysogeny Prophage detection Bacterial Typing Techniques Bacteriophages
http://linked.open...odStatuVydavatele	CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[0E2A750ED296]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	EB
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	4 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	4 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Molecular diagnostic, epidemiology and classification of pathogenic Gram positive cocci
http://linked.open...UplatneniVysledku	2002
http://linked.open...v/svazekPeriodika	24
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Doškař, Jiří Kvardová, Veronika Pantůček, Roman Oráčová, Eva
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/MSM%20143100008
issn	1210-6267
number of pages	1 (xsd:int)
http://localhost/t...ganizacniJednotka	14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software