About: Single-Strand Sequencing of PCR Products of the MBL2 Gene with a Polyadenylated Sequencing Primer

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Single-Strand Sequencing of PCR Products of the MBL2 Gene with a Polyadenylated Sequencing Primer Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
rdfs:seeAlso	http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2012_08_783-787.pdf
Description	Ve skupině 24 pacientek s rekurentní vulvovaginální kandidózou a 24 zdravých žen jsme analyzovali polymorfní místa v 5' nepřekládaném konci a kodonech 52, 54 a 57 genu MBL2. Pomocí PCR jsme amplifikovali produkty o délce 317 bp, které obsahovaly všechny zmíněné polymorfní místa. Purifikované amplikony vyly použity pro sekvenační reakce obsahující konvenční a polyadenylované přímé (forward) primery. Prokázali jsme, že polyadenylovaný primer použitý při sekvenační reakci prodlužuje čitelnost MBL2 amplikonů bez nutnosti oboustranného sekvenování, subklonování nebo reamplifikace s jiným párem primerů. Naše předběžná data ukázala, že distribuce alel, haplotypů a genotypů genu MBL2 u osob vulvovaginální kandidózou a zdravých osob se vzájemně statisticky významně neliší. Ve skupině 24 pacientek s rekurentní vulvovaginální kandidózou a 24 zdravých žen jsme analyzovali polymorfní místa v 5' nepřekládaném konci a kodonech 52, 54 a 57 genu MBL2. Pomocí PCR jsme amplifikovali produkty o délce 317 bp, které obsahovaly všechny zmíněné polymorfní místa. Purifikované amplikony vyly použity pro sekvenační reakce obsahující konvenční a polyadenylované přímé (forward) primery. Prokázali jsme, že polyadenylovaný primer použitý při sekvenační reakci prodlužuje čitelnost MBL2 amplikonů bez nutnosti oboustranného sekvenování, subklonování nebo reamplifikace s jiným párem primerů. Naše předběžná data ukázala, že distribuce alel, haplotypů a genotypů genu MBL2 u osob vulvovaginální kandidózou a zdravých osob se vzájemně statisticky významně neliší. (cs) In a group of 24 patients with recurrent vulvovaginal candidiasis and 24 healthy subjects we analysed polymorphic sites in the 5' untranslated region (5' UTR) and codons 52, 54, and 57 of the MBL2 gene. Using PCR we amplified 317 bp MBL2 products covering all the polymorphisms. Purified amplicons were used in cycle sequencing reactions containing conventional or polyadenylated forward primers. We revealed that the polyadenylated primer used in the cycle sequencing extends the readable range of MBL2 amplicons without necessity of doublestrand sequencing, subcloning or reamplification with other pair of primers. Our preliminary data showed that the distribution of MBL2 alleles, haplotypes, and genotypes in the patients and healthy subjects was very similar and the differences were not statistically significant. (en)
Title	Single-Strand Sequencing of PCR Products of the MBL2 Gene with a Polyadenylated Sequencing Primer (en) Jednosměrné sekvenování PCR produktů MBL2 genu pomocí polyadenylovaného sekvenačního primeru Jednosměrné sekvenování PCR produktů MBL2 genu pomocí polyadenylovaného sekvenačního primeru (cs)
skos:prefLabel	Single-Strand Sequencing of PCR Products of the MBL2 Gene with a Polyadenylated Sequencing Primer (en) Jednosměrné sekvenování PCR produktů MBL2 genu pomocí polyadenylovaného sekvenačního primeru Jednosměrné sekvenování PCR produktů MBL2 genu pomocí polyadenylovaného sekvenačního primeru (cs)
skos:notation	RIV/00179906:_____/12:10128441!RIV13-MZ0-00179906
http://linked.open...avai/predkladatel	Fakultní nemocnice Hradec Králové
http://linked.open...avai/riv/aktivita	I P
http://linked.open...avai/riv/aktivity	I, P(LC531), P(NT11334)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika	8
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2013
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Beránek, Martin Drastíková, Monika Buchta, Vladimír Petera, Jiří Špaček, Jiří Kestřánek, Jan
http://linked.open.../riv/druhVysledku	J - Článek v odborném periodiku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Fakultní nemocnice Hradec Králové
http://linked.open...dnocenehoVysledku	143672
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/00179906:_____/12:10128441
http://linked.open...riv/jazykVysledku	cze - čeština
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	polyadenylated primer; PCR; sequencing; polymorphism; DNA (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	polyadenylated primer DNA PCR polymorphism sequencing
http://linked.open...odStatuVydavatele	CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[A688DBE0FE82]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	Chemické listy
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	EB
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	6 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	6 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Centre on molecular biology and physiology of yeast communities Genetic prediction of late toxicity of radiotherapy for cervical cancer
http://linked.open...UplatneniVysledku	2012
http://linked.open...v/svazekPeriodika	106
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Beránek, Martin Buchta, Vladimír Drastíková, Monika Petera, Jiří Špaček, Jiří Kestřánek, Jan
http://linked.open...ain/vavai/riv/wos	000314233700011
issn	0009-2770
number of pages	5 (xsd:int)
is http://linked.open...avai/riv/vysledek of	Jednosměrné sekvenování PCR produktů MBL2 genu pomocí polyadenylovaného sekvenačního primeru

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 35 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software