The main aim of our reaserch project is design and optimalisation of new rapid viral hemorrhagic fevers' (VHF) detection and identification system targeting main causative pathogens. The system will be based on two steps: primary rapid detection and identification of viral family using Real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and secondary pointed use of the same method for causative pathogen precise species determination. Output of this project will be concept of new rapid economic VHF diagnostic technique, fitting its detection limits, difficulty and material requiremets of Czech army biological defense forces. (en)
Hlavním cílem našeho výzkumného projektu je vytvoření a optimalizace nového rychlého diagnostického systému detekce a identifikace původců virových hemoragických horeček (VHF), který bude postihovat hlavní kauzální patogeny. Systém bude založen na prvotní rychlé detekci a identifikaci virové čeledi původce metodou reverzně transkripční polymerázové řetězové reakce (Real time RT-PCR) a následném cíleném druhovém dourčení patogenu v rámci již zjištěné virové čeledi pomocí metody jednotlivých Real time RT-PCR reakcí. Výstupem tohoto výzkumného projektu bude tedy návrh metody rychlé a cenově přijatelné diagnastiky původců VHF, která bude svoji hranicí detekce, obtížností a přistrojovým vybavením vyhovovat zavedení v jednotkách sil biologické ochrany AČR.
Hlavními výsledky projektu jsou zavedené PCR metodiky pro detekci vybraných původců virových hemoragických horeček na úrovní detekce čeledi (Filoviridae, Arenaviridae a Flaviviridae) a na úrovni jednotlivého virového patogenu (z výše uvedených čeledí a čeledi Bunyaviridae). Dále byla zavedena metodika pro přípravu vhodného biologického vzorku pro diagnostiku metodou elektronové mikroskopie. (cs)
The main results of this project are approved PCR protocols for detection of chosen pathogens of viral hemorrhagic fevers on step of viral families (Filoviridae, Arenaviridae and Flaviviridae), on step of single viral pathogen (members of all mentioned viral families and some viruses from Bunyaviridae). Next result is approved procedures of suitable sample preparation for electron microscopy. (en)