About: Analysis of chromosome pairing and recombination of homeologous chromosomes in (paleo)polyploid Brassicaceae species

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Analysis of chromosome pairing and recombination of homeologous chromosomes in (paleo)polyploid Brassicaceae species Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=MEB020828
Description	Amfidiploid genome of Brassica napus (AC genome; 2n=38) has been established via interspecific hybridization between B. oleracea (C; 2n=18) and B. rapa (A; 2n=20). Dr. Jenczewski et al. showed the different recombination frequency between homeologous chromosomes as well as chromosome rearrangements in some haploid B. napus (n=19) lines. The goal of this project is a detailed molecular and cytogenetic analysis of homeologous chromosome pairing in the B. napus genome. To fulfil this target, identification of A- and C-genome derived chromosomes is necessary. Chromosome painting using chromosome-specific BAC clones of Arabidopsis thaliana and B. rapa has been shown as an efficient method of chromosome identification. Chromosome painting using larger DNA probes (BAC contigs) will be used to characterize potential chromosome rearrangements in the B. napus genome. Comparative analysis of homeologous chromosome pairing will be also carried out in related paleohexaploid species of the tribe Brassiceae. Experi (en) Amfidiploidní genom řepky olejky (Brassica napus; 2n=38, AC genom) vznikl hybridizací diploidních brukví B. oleracea (C; 2n=18) a B. rapa (A; 2n=20). Dr. Jenczewski et al. prokázali rozdílnou frekvenci rekombinace mezi homeologními chromosomy a výskyt chromosomových přestaveb u vybraných haploidních linií B. napus (n=19). Cílem projektu je detailní molekulárně-cytogenetická analýza meioticého párování homeologních chromosomů v genomu B. napus. Nezbytným předpokladem této analýzy je identifikace A a C chromosomů pomocí chromosomově specifických cytogenetických markerů. Efektivní metodou se v tomto směru ukázal být chromosomální painting, využívající chromosomově specifické BAC klony Arabidopsis thaliana a B. rapa, v kombinaci s in situ lokalizací genomově specifických centromerických sekvencí a rDNA sond. Chromosomální painting s většími DNA sondami (BAC kontigy) bude také použit k charakterizaci potenciálních chromosomových přestaveb v genomu B. napus. Komparativní analýza karyotypu a homeologního p
Title	Analysis of chromosome pairing and recombination of homeologous chromosomes in (paleo)polyploid Brassicaceae species (en) Analýza párování a rekombinace homeologních chromosomů u (paleo)polyploidních druhů brukvovitých (Brassicaceae)
skos:notation	MEB020828
http://linked.open...avai/cep/aktivita	KONTAKT
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/MEB020828/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/MEB020828/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2010-06-30 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	M2 - Mezinárodní spolupráce podle uzavřených smluv o dvoustranné mezinárodní spolupráci ve VaV
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65887970
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Brassicaceae; Brassica; meiosis; chromosome pairing; polyploidy; recombination; chromosome painting; chromosome homeology (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Masarykova univerzita
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-01 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/6094%2F2009-32
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2008-07-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	The Czech-French project aimed to foster an in-depth description of meiotic chromosome pairing and recombination in Brassica napus haploids and derived hybrids and in several Brassicaceae species endemic to Australia (studied by the Czech group). This close cooperation resulted in several presentations at national and intenational meetings and in two scientific publications. (en) Cílem byl detailní popis párování meiotických chromosomů a rekombinace u haploidů a hybridů druhu Brassica napus (studovaný francouzským týmem) a u několika druhů Australských endemitů z čeledi brukvovitých (studovány českým týmem). Spolupráce vyústila v několik prezentací na národních i mezinárodních fórech a vzniku nejméně dvou vědeckých publikací. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Brassicaceae Brassica meiosis polyploidy recombination chromosome painting chromosome pairing
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB020828/2008/ico%3A00216224 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB020828/2009/ico%3A00216224 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB020828/2010/ico%3A00216224

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 67 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software