About: Study of the interactions between forkhead transcription factor AFX and DNA.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Study of the interactions between forkhead transcription factor AFX and DNA. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=LZ1K03020
Description	AFX belongs to FOXO subfamily of Forkhead transcription factors, which are involved in metabolism control, embryogenesis, apoptosis, and tumorigenesis. Activity of these transcription factors is controlled through the phosphorylation by the proteinkinase B and association with 14-3-3 proteins. FOXO transcription factors specifically bind DNA sequence T(G/A)TTTTG, which is known as an insulin response element (IRE). Only small number of structures describing interactions between DNA-binding domainand DNA is available today. Therefore it is impossible to perform detailed structural analysis of interactions between FOXO DNA-binding domain and DNA, and define structural elements responsible for binding specificity. This project suggests to performthis structural analysis using protein crystallography and fluorescence spectroscopy. Such analysis will allow to understand the regulation of DNA-binding specificity as well as overall regulatory mechanism of these important transcription factors. (en) AFX patří do FOXO podrodiny Forkhead transkripčních faktorů, které hrají důležitou roli při kontrole metabolismu, embryogenezi, apoptóze, nebo onkogenezi. Aktivita těchto transkripčních faktorů je regulována fosforylací protein kinázou Ba interakcí se 14-3-3 proteiny. FOXO transkripční faktory specificky váží DNA sekvenci T(G/A)TTTTG, která je známá jako “insulin response element (IRE). V současné době je k dispozici málo strukturních dat popisujících interakce mezi FOXODNA-vazebnou doménou a DNA. To znemožňuje provést strukturní analýzu interakcí FOXO DNA-vazebných domén s DNA a definovat strukturní prvky, které jsou jednoznačně zodpovědné za vazebnou specifitu těchto domén. Tento projekt proto navrhuje provésttuto strukturní analýzu pomocí proteinové krystalografie a fluorescenční spektroskopie. To umožní lépe pochopit mechanismus regulující DNA vazebnou specifitu a vůbec mechanismus celkové regulace těchto biologicky důležitých transkripčních faktorů.
Title	Study of the interactions between forkhead transcription factor AFX and DNA. (en) Studium interakcí forkhead transkripčního faktoru AFX s DNA
skos:notation	LZ1K03020
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Support of incipient R&D workers
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LZ1K03020/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LZ1K03020/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-05-29 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33688762
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	IF - Infrastruktura výzkumu a vývoje
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Forkhead transcription factor; AFX; DNA binding; protein crystallography; fluorescence spectroscopy (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMSM200300001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie BO - Biofyzika
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Vazebné vlastnosti DNA vazebné domény transkripčního faktoru AFX (FoxO4) jsou modulovány konformačními změnami vazebného místa pro DNA v důsledku vazby regulačního 14-3-3 proteinu, který ovlivňuje strukturu různých částí DNA vazebné domény AFX. (cs) Binding properties of DNA binding domain of transcription factor AFX are modulated through conformational changes of the binding site as a consequence of the 14-3-3 protein binding. 14-3-3 changes structure of various parts of DNA binding domain of AFX. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	DNA binding protein crystallography AFX Forkhead transcription factor
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	14-3-3 Protein interacts with nuclear localization sequence of forkhead transcription factor FoxO4. Protein modeling combined with spectroscopic techniques: an attractive quick alternative to obtain structural information. Protein modeling combined with spectroscopi techniques: an attractive quick alternative to obtain structural information 14-3-3 Protein C-terminal stretch occupies ligand binding groove and is displaced by phosphopeptide binding
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LZ1K03020/2003/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LZ1K03020/2004/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LZ1K03020/2005/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LZ1K03020/2006/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 84 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software