About: Mesoscopic Modeling of Protein-Surface Interactions

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Mesoscopic Modeling of Protein-Surface Interactions Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=LH12020
Description	The project aims to contribute to fundamental understanding of protein adsorption on homogeneous and heterogeneous surfaces. Mesoscopic modeling using dissipative particle dynamics will be employed to systematically study the effect of shape, size and hydrophobicity/hydrophilicity of proteins on their adsorption kinetics. Mesoscale models of proteins and surfaces will be obtained from atomistic simulations of individual proteins in water and individual proteins close to walls using mapping from the atomistic to mesoscopic level. The mesoscopic modeling will be complemented by macroscopic modeling based on kinetic models of adsorption processes and the mesoscopic simulation results will be compared with experiments. (en) Cílem projektu je přispět k základnímu pochopení mechanismu adsorpce/desorpce proteinů na homogenních a heterogenních površích. Pomocí mesoskopických simulací založených na disipativní částicové dynamice bude systematicky studován efekt tvaru, velikosti a hydrofobicity/hydrofilicity proteinů na jejich adsorpční kinetiku. Mesoskopické modely proteinů a povrchů budou navrženy na základě molekulárních simulací jednotlivých proteinů ve vodě a v blízkosti stěn pomocí mapování z atomární na mesoskopickou úroveň. Mesoskopické modelování bude doplněno makroskopickým modelováním založeným na kinetických modelech adsorpčních procesů a výsledky mesoskopických simulací budou přímo srovnány s experimentálními daty.
Title	Mesoscopic Modeling of Protein-Surface Interactions (en) Mesoskopické modelování interakce proteinů s povrchy
skos:notation	LH12020
http://linked.open...avai/cep/aktivita	KONTAKT II
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LH12020/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LH12020/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	101045783
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	atomistic modeling; dissipative particle dynamics; homogeneous and heterogeneous surfaces; protein adsorption; protein-surface interaction; macroscopic modeling; mesoscopic modeling (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav chemických procesů Akademie Věd ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	8 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	8 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-06 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/MSMT-6805%2F2013-311
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMSM2012LH2
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	BJ - Termodynamika BO - Biofyzika
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-03-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBK
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	dissipative particle dynamics protein adsorption homogeneous and heterogeneous surfaces macroscopic modeling protein-surface interaction atomistic modeling
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Dissipative Particle Dynamics Study of Electrostatic Self-Assembly in Aqueous Mixtures of Copolymers Containing One Neutral Water- Soluble Block and One Either Positively or Negatively Charged Polyelectrolyte Block Morphology and molecular bridging in comb- and star-shaped The Liquid Surface of Chiral Ionic Liquids as Seen from Molecular Dynamics Simulations Combined with Intrinsic Analysis Air-liquid interfaces of imidazolium-based [TF2N?] ionic liquids: insight from molecular dynamics simulations An enhanced entangled polymer model for dissipative particle dynamics Towards molecular dynamics simulations of chiral room-temperature ionic liquids Molecular Simulation of Aqueous Electrolyte Solubility. 3. Alkali-Halide Salts and Their Mixtures in Water and in Hydrochloric Acid Molecular Dynamics Simulations of n-Hexane at 1-Butyl-3-Methylimidazolium bis(trifluoromethylsulfonyl) Imide Interface
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12020/2012/ico%3A67985858 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12020/2013/ico%3A67985858 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12020/2014/ico%3A67985858 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12020/2015/ico%3A67985858

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 80 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software