About: Karyotype evolution in the mustard family (Brassicaceae)

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Karyotype evolution in the mustard family (Brassicaceae) Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB601630606
Description	Evolutionary changes of chromosomes and karyotypes over time can be studied by comparative chromosome painting (CCP). CCP refers to visualization of homeologous chromosome regions/whole chromosomes shared by two or more species. Among plants this technique is only feasible for the mustard family (Brassicaceae). In the project, a robust infrastructure for CCP within Brassicaceae will be established. Painting probes for all chromosomes of Arabidopsis thaliana (thale cress) will be used to identify homeologous chromosomes in other cruciferous species. These experiments will reveal chromosomal changes responsible for the deviating chromosome numbers and define ancient versus advanced karyotypes. Comparisons of chromosomal homeology patterns with molecular phylogenetic distances will provide unique insights into the general trends and timing of karyotype evolution in Brassicaceae, and the role of chromosomal changes in plant speciation. (en) Evoluční přestavby karyotypu mohou být rekonstruovány pomocí komparativního chromosomálního paintingu (KCP). Metoda KCP je založena na vizualizaci homeologických chromosomálních úseků/celých chromosomů sdílených dvěmi nebo více druhy. U rostlin je tato technika aplikovatelná jen u zastupců čeledi brukvovitých (Brassicaceae). Navrhovaný projekt si klade za cíl vytvořit nezbytné technické a metodologické zázemí pro širší aplikaci KCP v rámci Brassicaceae. KCP s použitím DNA sond pro všechny chromosomy huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) umožní identifikovat homeologické chromosomy u dalších druhů. Navrhované experimenty dovolí specifikovat chromosomální změny zodpovědné za rozdílné chromosomové počty a definovat ancestrální a odvozené karyotypy. Porovnání chromosomálních a molekulárně-fylogenetických dat poskytne jedinečné informace o obecných trendech a časové struktuře evoluce karyotypu brukovitých, stejně jako o roli chromosomálních přestaveb při vzniku rostlinných druhů.
Title	Karyotype evolution in the mustard family (Brassicaceae) (en) Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
skos:notation	KJB601630606
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB601630606/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB601630606/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2013-11-05 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	69283419
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	comparative chromosome painting; Arabidopsis; Brassicaceae; crucifers; karyotype and chromosome evolution; genome colinearity; BAC; multicolour FISH; plant molecular phylogenetics and systematics; plant phylogenomics (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	18 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	18 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2008-02-21 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/KJB601630606
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2008
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2009
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02006-B
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2008-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byla vytvořena infrastruktura pro komparativní chromosomální painting v čeledi Brassicaceae, rekonstruována evoluce karyotypu a velikosti genomu u několika skupin brukvovitých, navržen koncept 2 ancestrálních karyotypů (ACK a PCK) v čeledi brukvovitých. (cs) Infrastructure for comparative chromosome painting across the Brassicaceae was established. Karyotype evolution and genome size evolution have been reconstructed in several crucifer groups, 2 ancestral crucifer karyotypes (ACK and PCK) were proposed. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Arabidopsis BAC Brassicaceae crucifers multicolour FISH genome colinearity karyotype and chromosome evolution plant molecular phylogenetics and systematics comparative chromosome painting
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Ancestral Chromosomal Blocks Are Triplicated in Brassiceae Species with Varying Chromosome Number and Genome Size Karyotype evolution in n=7 species from different tribes of the mustard family (Brassicaceae) New insights into comparative phylogenomics of crucifers (Brassicaceae). Karyotype evolution in n=7 species from different tribes of the mustard family (Brassicaceae) Chromosomal phylogeny and karyotype evolution in x=7 crucifer species (Brassicaceae) The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae Comparative Cytogenetics of Wild Crucifers A bicontinental origin of polyploid Australian/New Zealand Lepidium species (Brassicaceae)? Evidence from genomic in situ hybridization The ABC’s of comparative genomics in the Brassicaceae: building blocks of crucifer genomes Chromosome arrangement and nuclear architecture but not centromeric sequences are conserved between Arabidopsis thaliana and Arabidopsis lyrata Supernetwork identifies multiple events of plastid trnF(GAA) pseudogene evolution in the Brassicaceae Unexpected paleopolyploid evolution in Stenopetalum - a genus with the lowest chromosome numbers in the Brassicaceae Unexpected paleopolyploid evolution in Stenopetalum - a genus with the lowest chromosome numbers in the Brassicaceae Punctuated genome size evolution in Liliaceae Phylogeny, Genome, and Karyotype Evolution of Crucifers (Brassicaceae) Evolutionary and comparative cytogenetics of the Brassicaceae and Cleomaceae Paleopolyploidy And Karyotype Evolution In Crucifers (Brassicaceae) Diving deeper into the crucifer genomes
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB601630606/2006/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB601630606/2007/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB601630606/2008/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB601630606/2009/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 117 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software