About: Transcriptome of the exo70A1 mutant and cellular roles of EXO70A1, a putative subunit of the exocyst complex, in Arabidopsis thaliana

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Transcriptome of the exo70A1 mutant and cellular roles of EXO70A1, a putative subunit of the exocyst complex, in Arabidopsis thaliana Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB600380802
Description	The exocyst complex is involved in final steps of exocytosis. Cell functions of the exocyst have been studied in yeast and animal cells, however due to sessile biology of the plant cell, plant specific functions could be expected. As suggested by a discernible phenotype of mutants in EXO70A1 gene, coding for one of eight putative exocyst subunits, the importance of the exocyst in plants (Arabidopsis) is evident. In this project, we would like to continue detailed analysis of exo70A1 mutants that were generally described in our previous research. We plan to begin with transcriptomic approach using microarray DNA chips analysis that could reveal gene interactions of EXO70A1 and could point to its functions. Employing techniques of molecular biology and microscopy such as immunolocalization, GFP fusions and pharmacology, this project should contribute to more detailed understanding of functions of EXO70A1 and exocyst, respectively, in the plant cell. (en) Komplex exocyst se v buňce účastní finálních kroků exocytózy. Vzhledem k odlišnostem živočišných a kvasinkových buněk, kde byl doposud studován, od buňky rostlinné můžeme u rostlin předpokládat i řadu rozdílných funkcí. O významu komplexu exocyst u rostlin svědčí například dramaticky změněný fenotyp mutantů Arabidopsis v genu EXO70A1 kódujícím velmi pravděpodobně jednu z osmi podjednotek tohoto komplexu. Na popis mutantů exo70A1, který jsme provedli v rámci předchozího výzkumu, bychom chtěli navázat jejich detailnější analýzou. Zejména analýza kompletního transkriptomu mutantů exo70A1 pomocí tzv. DNA čipu jistě odhalí interagující geny a ukáže na další možné funkce EXO70A1. Tento projekt by měl přispět pomocí molekulárně biologických a mikroskopických technik (např. imunolokalizace, GFP fúze, farmakologie) k detailnějšímu poznání role EXO70A1, resp. exocystu, v rostlinné buňce.
Title	Transcriptome of the exo70A1 mutant and cellular roles of EXO70A1, a putative subunit of the exocyst complex, in Arabidopsis thaliana (en) Transkriptom mutanta exo70A1 a buněčné funkce EXO70A1, předpokládané podjednotky komplexu exocyst, u Arabidopsis thaliana
skos:notation	KJB600380802
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB600380802/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB600380802/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2011-06-14 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82503999
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	EXO70; cell morphogenesis; exocytosis; exocyst; Arabidopsis thaliana; transcriptome (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-03-09 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/KJB600380802
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02008-B
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2008-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	EXO70A1, an exocyst subunit, is localized to maturating cytokinetic walls during cytokinesis. It interacts with NOI6 modulating response to pathogens. The exo70A1 mutant shows defects in cytokinesis and shoot meristem, and changes in gene transcription. (en) Podjednotka exocystu EXO70A1 se při buněčném dělení lokalizuje do zrající cytokinetické přepážky. Interaguje s NOI6 regulujícím odpověď na pathogeny. Mutant exo70A1 vykazuje defekt v cytokinezi a meristému stonku, má změněnu transkripci řady genů. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	EXO70 Arabidopsis thaliana cell morphogenesis exocyst exocytosis
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Arabidopsis RAB geranylgeranyl transferase beta-subunit mutant is constitutively photomorphogenic, and has shoot growth and gravitropic defects The Arabidopsis Exocyst Complex Is Involved in Cytokinesis and Cell Plate Maturation The role for the exocyst complex subunits Exo70B2 and Exo70H1 in the plant-pathogen interaction The exocyst complex contributes to PIN auxin efflux carrier recycling and polar auxin transport in Arabidopsis
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB600380802/2008/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB600380802/2009/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB600380802/2010/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB600380802/2011/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 26 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software