About: Sequencing of the bovine herpesvirus-1 DNA

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Sequencing of the bovine herpesvirus-1 DNA Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA5052706
Description	Participation in the international bovine herpesvirus-1 (BHV-1) genome project is proposed. BHV-1 is a pathogen causing infectious bovine rhinotracheitis, a disease of major economic concern. The genome project is coordinated by the University of Zurich, and 15 laboratories worldwide are participating. BHV-1 DNA is 74% GC-rich, which makes its sequencing difficult. We constructed specialized vectors and worked out strategies for sequencing DNA with extreme base composition. This makes conditions favourable for our participation in the project. Selected DNA regions will be partially digested with HinPI restriction enzyme, and the resulting fragments will be cloned with M13 vectors linearized with AccI. Contigs will be assembled using the GeneSkipper software. (en) Navrhuje se účast v mezinárodním genomovém projektu s cílem stanovit úplnou nukleotidovou sekvenci genomu bovinního herpesviru 1 (BHV-1). BHV-1 je pathogen vyvolávající infekční rhinotracheitis s vážnými ekonomickými dopady. Genomový projekt je koordinován univerzitou v Zurichu a zůčastňuje se ho 15 laboratoří.DNA viru je bohatá na páry GC (74%), což činí sekvenaci obtížnou. Konstruovali jsme specializované vektory a vypracovali strategii pro sekvenaci DNA s extrémním složením bazí. Podmínky pro naši úspěšnou účast v tomto projektu jsou proto dobré. Selektované oblasti DNA budou parciálně štěpen restrikčním enzymeme HinPI a fragmenty budou klonovány s vektorem M13 linearizovaným AccI. Kontigy budou sestavovány pomocí programů GeneSkipper.
Title	Sequencing of the bovine herpesvirus-1 DNA (en) Sekvenace DNA bovinního herpesviru-1 (účast v mezinárodním genomovém projektu)
skos:notation	IAA5052706
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA5052706/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA5052706/celkoveNaklady
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	503767
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2000
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2000
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byl dokončen mezinár. gen. projekt %22Genom bovinního herpesviru-1%22. V sekvenované DNA jsme identifikovali 71 genů a regulační elementy, které řídí expresi těchto genů. Ze všech zúč. laboratoří jsme k projektu přispěli nejvíce. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Genomics on the Eve of the 21th Century. Genomics for Biotechnology.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052706/1997/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052706/1998/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052706/1999/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052706/2000/ico%3A68378050

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 12 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software