| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - The DNA condensation is crucial for transport of DNA inside living cells, i.e. for non-viral gene therapy. Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) is a very sensitive tool for visualizing the DNA shape changes. However, the obtained data are still poorly understood and therefore lot of information is lost. We suggest employing Monte-Carlo simulations of the FCS output for the given system and comparing them with real measurements. Together with light scattering techniques, common fluorescence studies and time-resolved FCS, we would like to get deeper insight into the process itself and to explore new condensers, i.e. their condensing efficiency and their ability to protect DNA against hydrolysis within cytoplasm. During the last three years we intend to use the in vitro experience for in vivo measurements in order to follow the fate of DNA in cellular compartments of interest after being accepted by cells. (en)
- Kondenzace DNA hraje klíčovou úlohu při transportu DNA do buněk, tj. v genové terapii. Fluorescenční korelační spektroskopie (FCS) je citlivá metoda ke sledování konformačních změn v průběhu tohoto procesu, jak ukazují mnohé studie provedené v naší skupině. Dosud aplikovaná analýza dat ale zdaleka neposkytuje veškeré informace o studovaném problému. Navrhujeme tedy simulovat pomocí Monte-Carlo volnou difúzi DNA molekuly a z toho plynoucí výsledek FCS experimentu a ten porovnat s reálnými daty a současně s rozptylovými měřeními, která jsou s FCS komplementární. S využitím těchto informací a již získaných zkušeností s kondenzacemi se chceme věnovat studiu nových kondenzačních činidel, tj. efektivitě jejich účinku a schopnosti chránit DNA před nežádoucí hydrolýzou v cytosolu. V posledních třech letech bychom rádi využili zkušenosti získané z experimentů in vitro také při měření in vivo, tj. sledování, v jaké podobě je buňkou akceptovaná DNA přítomná ve významných buněčných organelách.
|
| Title
| - DNA Condensation: Monte-Carlo Simulations, Light Scattering, Fluorescence Correlation Spectroscopy in vitro and in vivo. (en)
- Kondenzace DNA: Monte-Carlo simulace, rozptyl světla, fluorescneční korelační spektroskopie in vitro a in vivo.
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - DNA condensation; non-viral gene therapy; transfection; fluorescence correlation spectroscopy; Monte-Carlo simulation; light scattering; time-resolved FCS; condensing agents; fluoresncence microscopy; FLIM (fluorescence lifetime imaging) (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy was developed and used for elucidating the condensation mechanisms of DNA molecules. The efficiencies of the newly synthesized condensing agents were characterized and connected to their in vivo applications (en)
- Fluorescenšní korelační spektroskopie s měřením dob života byla vyvinuta a používána k vysvětlení mechanismu kondensace molekul DNA. Účinnost nově syntetizovaných kondensačních činidel byla charakterizována a dána do souvislosti s jejich využitím in vivo (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - Monte-Carlo simulation
- condensing agents
- fluorescence correlation spectroscopy
- fluoresncence microscopy
- light scattering
- non-viral gene therapy
- time-resolved FCS
- transfection
- DNA condensation
|
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)