About: Hemicatenated DNA loops: their occurence in humen genome and recognition by tumor suppressor protein p53

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Hemicatenated DNA loops: their occurence in humen genome and recognition by tumor suppressor protein p53 Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA400040702
Description	Results of mapping of human genome provided evidence that DNA sequences encoding proteins represented only ~3% of human genome. Alternative DNA structures are of particular interest as potential signals to mark important sites on the genome. The CA-microsatelittes are repetitive poly(CA).poly(TG) sequences spread in all eukaryotic genomes. These (and other) sequences can form in vitro a loop maintained at its base by a hemicatenane (hcDNA). hcDNA is specifically recognized and bound by HMGB1 protein which has been implicated in transcription, DNA repair, cell signalling, stimulation of tumor growth and metastasis. We have recently discovered that tumor suppressor protein p53 can bind with high affinity to hcDNA [Štros, M. et al. (2004) Biochemistry 43, 7215-7225]. The goal of the project is to search for stable DNA hemicatenanes in human genome and to determine consequences of p53 binding to hcDNA for the functiong of the protein as transactivator of p53-responsive genes. (en) Výsledky mapování lidského genomu vedou k závěru, že sekvence DNA kódující proteiny představují pouze ~ 3% lidského genomu. Alternativní struktury DNA jsou zajímavé jako potenciální signální místa označující významné oblasti genomu. CA-mikrosatelity jsou repetitivní sekvence poly (CA).poly(TG), které se vyskytují ve všech eukaryotních genomech. Tyto (i jiné) sekvence jsou schopny vytvářet in vitro různě dlouhé smyčky (DNA loop) stabilizované hemikatenanem (hcDNA). hcDNA je specificky rozpoznávána proteinem HMGB1, který je významný pro transkripci, opravu DNA, rekombinaci, buněčnou signalizaci, růst nádorů a metastáz. Nedávno jsme prokázali, že nádorově supresorový protein p53 specificky rozpoznává hcDNA [Štros, M. et al. (2004) Biochemistry 43,7215-7225]. Hlavním cílem projektu je pokusit se o důkaz existence hemikatenanů v lidském genomu a objastnit biologický význam interakce p53 s hcDNA pro funkci tohoto proteinu při indukci apoptózy a zástavy buněčného cyklu.
Title	Hemicatenated DNA loops: their occurence in humen genome and recognition by tumor suppressor protein p53 (en) Hemikatenátové smyčky DNA: jejich výskyt v lidském genomu a rozpoznávání nádorově supresorovým proteinem p53
skos:notation	IAA400040702
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA400040702/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA400040702/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2013-06-28 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82430735
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	DNA damage recognition proteins, p53, HMGB1, cisplatin, anticancer drugs (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-03-09 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/IAA400040702
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02007-A
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	FR - Farmakologie a lékárnická chemie FD - Onkologie a hematologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byla zjištěna schopnost HMGB1 stimulovat katenaci i dekatenaci kruhové DNA za přítomnosti topoizomerázy IIalfa. Byla vypracována metoda přípravy hemikatenanů a zjištěna extrémní afinita HMGB1 a p53 k těmto strukturám DNA. (cs) The ability of HMGB1 to promote catenation and decatenation of circular DNA by topoisomerase IIalpha was shown. A method for preparation of DNA hemicatenanes was developed. An extreme affinity of HMGB1 and p53 for DNA hemicatenanes was demonstrated. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	HMGB1 cisplatin p53 DNA damage recognition proteins
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	HMGB1 and HMGB2 proteins up-regulate cellular expression of human topoisomerase IIalpha HMGB proteins: Interactions with DNA and chromatin HMGB1 contributes to chromosome stability by telomerase activation HMGB1 interacts with human topoisomerase IIalpha and stimulates its catalytic activity HMGB1 contributes to chromosome stability by telomerase activation The HMG-box: a versatile protein domain occurring in a wide variety of DNA-binding proteins
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040702/2007/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040702/2008/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040702/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040702/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040702/2011/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 91 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software