About: Where does a species start and end? Speciation in a ring studied in the era of phylogenomics with application to European spined loaches

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Where does a species start and end? Speciation in a ring studied in the era of phylogenomics with application to European spined loaches Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP506/12/P857
Description	The leading question in speciation studies is whether species can arise in the absence of geographic barriers. An excellent opportunity to study such a divergence arises where reproductively isolated populations coexist while being connected by apparently gradual variation around geographic barrier: ring species. Here we bring a new assumed ring species model for science from freshwaters: cryptic complex of spined loaches encircling the Black Sea. The principal aims are to apply state of the art methods of phylogenomics and to collect spatial genetic variation across the genomes in spined loaches to examine the role of temporal evolutionary forces that might have been responsible for their contemporary genomic architecture along the ring. The use of many markers will help us to define the population units and stages of speciation along them. Moreover, the genomic era opens new opportunities to identify candidate speciation mechanisms in understanding how populations diverge and give rise to distinct species and whether divergence with ongoing gene flow is possible or even common. (en) Přední otázkou studií speciace je zda mohou druhy vznikat bez přítomnosti geografických bariér. Unikátní příležitost studia takové divergence nabízí druh(y) žijící v kruhu, kde reprodukčně izolované koncové populace jsou propojeny postupnou variabilitou okolo geografické bariéry. V projektu nabízíme nový model sladkovodních populací ryb žijících v kruhu: kryptický druhový komplex sekavců obklopující Černé moře. Hlavními cíli projektu je použít nejmodernější metody fylogenomiky a získat informaci o prostorové genetické variabilitě napříč genomy sekavců k objasnění role historických evolučních sil, které by mohly být zodpovědné za současnou genomickou architekturu podél kruhu. Využití mnoha genetických markerů nám pomůže definovat populační jednotky a stádia speciace napříč populacemi. Navíc, éra genomiky otevírá nové příležitosti k identifikaci kandidátních speciačních mechanismů k porozumění, jak populace divergují a dávají vznik novým druhům, a dále, zda divergence za pokračujícího toku genů je možná či dokonce běžná.
Title	Where does a species start and end? Speciation in a ring studied in the era of phylogenomics with application to European spined loaches (en) Kde začíná a končí druh? Speciace v kruhu evropských sekavců studovaná v éře fylogenomiky
skos:notation	GPP506/12/P857
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP506%2F12%2FP857/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP506%2F12%2FP857/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-05-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	101099084
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EG - Zoologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	speciation gene flow spined loach next-generation sequencing the Black Sea phylogenomics (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P506-12-P857
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EH - Ekologie - společenstva EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Projekt zabývající se probelamatikou speciace u sekavců rodu Cobitis. Jedná se o zajímavé téma, neboť u tohoto rodu se vyskytují různé formy asexuálního rozmnožování a hybridizace. V rámci projektu byla získány cenná data, navázány důležité zahraniční spolupráce. Výsledky mají slibný publikační potenciál, dvě práce (ovšem s vícenásobnou dedikací) byly již publikovány. (cs) In this project, speciation processes in spined loaches complex around the Black Sea have been evaluated. This is an interesting topic, since asexual reproduction and hybridization occurs in this group. High quality data was obtained within the project and several important collaborations with foreign experts have been established. Two papers (with project dedication) have been already published. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Distinguishing between Incomplete Lineage Sorting and Genomic Introgressions: Complete Fixation of Allospecific Mitochondrial DNA in a Sexually Reproducing Fish (Cobitis; Teleostei), despite Clonal Reproduction of Hybrids Rise and Persistence of Animal Polyploidy: Evolutionary Constraints and Potential
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F12%2FP857/2015/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F12%2FP857/2012/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F12%2FP857/2013/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F12%2FP857/2014/ico%3A67985904

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software