About: Analýza fosfoproteomu leukemických buněčných linií po ozáření.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Analýza fosfoproteomu leukemických buněčných linií po ozáření. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP206/12/P338
Description	Phosphorylation is one of the most important post-translational modifications, which affects protein structure, function, and localization, regulating majority of biochemical processes. In our previous work we were engaged with molecular mechanisms of response of leukaemic cells MOLT-4 (p53-positive) and HL-60 (p53-negative)to ionising radiation. Submitted project proposes to characterize phosphoproteome of the mentioned cells, i.e. to identify phosphoproteins which are involved in radiation-induced signaling using tandem mass spectrometry, and to propose the potential biodosimetric markers. To date, no study has been published in the presented area mainly due to a very low abundance of phosphoproteins in the cell and due to insufficient ionization during MS analysis (acidic and hydrophilic character) compared to non-modified proteins. Therefore we will employ the newest methods for selective enrichment of phosphopeptides (bioaffinity chromatography) and recent knowledge to increase enrichment efficiency (methylation, pH adjustment etc.). (en) Fosforylace je jednou z nejdůležitějších posttranslačních modifikací, která ovlivňuje funkci, strukturu a lokalizaci proteinu a pomocí níž je regulována většina biochemických procesů. V naší předchozí práci jsme se zabývali molekulárními mechanismy odpovědi leukemických buněk MOLT-4 (p53-positivní) a HL-60 (p53-negativní) na ozáření. Předkládaný projekt si klade za cíl charakterizovat fosfoproteom těchto buněk, tj. identifikovat fosfoproteiny, které jsou součástí signálních drah spouštěných po expozici ionizujícímu záření, dále určit přesná místa fosforylace pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie a navrhnout potenciální biodosimetrické markery. Doposud v tomto směru nebyla publikována žádná práce a to zejména proto, že absolutní množství fosfoproteinů v buňce je velmi malé a vzhledem ke kyselému a hydrofilnímu charakteru je účinnost jejich ionizace při MS analýzách podstatně nižší než u nemodifikovaných peptidů. Proto hodláme zapojit nejnovější metody pro selektivní obohacení fosfopeptidů (bioafinitní chromatografie) a využít nových poznatků vedoucích k optimalizaci dané metodiky.
Title	Analýza fosfoproteomu leukemických buněčných linií po ozáření. Phosphoproteomic analysis of leukaemic cells after irradiation. (en)
skos:notation	GPP206/12/P338
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP206%2F12%2FP338/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP206%2F12%2FP338/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-05-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	101097902
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CB - Analytická chemie, separace
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	phosphoproteins mass spectrometry leukaemia ionising radiation (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Univerzita obrany - Fakulta vojenského zdravotnictví Hradec Králové
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-02-28 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P206-12-P338
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Výsledky projektu byly publikovány ve dvou originálních pracích a jedné rešerši v impaktovaných časopisech a jako dva postery na zahraničních konferencích. Cíle deklarované v projektu byly splněny; úpravy řešení vedly k získání výsledků nad rámec původních cílů. Na některé z výsledků naváže spolupracovnice v rámci společného projektu s přední švýcarskou proteomickou laboratoří. (cs) The project results were published in two original articles and one review in impacted journals and two posters in international conferences. The goals declared in the projects were fulfilled; modifications of the work lead to additional results with respect to the original goals. A collaborator will use some of the results for a joint project with a leading Swiss proteomic laboratory. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Comparison of Resins for Metal Oxide Affinity Chromatography with Mass Spectrometry Detection for the Determination of Phosphopeptides Enrichment strategies for phosphoproteomics: state-of-the-art Radiosensitization of Human Leukemic HL-60 Cells by ATR Kinase Inhibitor (VE-821): Phosphoproteomic Analysis
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F12%2FP338/2015/orjk%3AG44 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F12%2FP338/2012/orjk%3AG44 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F12%2FP338/2013/orjk%3AG44 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F12%2FP338/2014/orjk%3AG44

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software