About: Sequence-specific electrochemical sensing of PCR-amplified genomic DNA fragments

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Sequence-specific electrochemical sensing of PCR-amplified genomic DNA fragments Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP206/11/P739
Description	Several principles of electrochemical DNA sensing coupled to PCR amplification of specific DNA sequences were reported. Despite the apparently broad palette of techniques designed, there are still many questions to be answered before application of the electrochemical approaches in routine DNA sensing/diagnostic. This project is focused on testing various electrochemical detection protocols for analysis of “real” genome DNA amplified with PCR. We will investigate methods involving (i) hybridization of an internal nucleotide sequence of a PCR product with DNA probes followed by label-free or label-based electrochemical detection or (ii) the incorporation of chemically modified nucleotides (markers producing specific electrochemical responses) into the PCR amplicons etc. We will select techniques exhibiting optimum analytical performance and apply them to meet typical diagnostic tasks - detection of point mutations/single nucleotide polymorphisms, analysis of the length of repetitive sequences or monitoring of gene expression. (en) Doposud byly navrženy různé principy elektrochemické analýzy DNA spojené s amplifikací specifické sekvence DNA pomocí PCR. Přes tuto zdánlivě širokou paletu technik je stále potřeba zodpovědět řadu otázek týkajících se využití elektrochemických přístupů při rutinní detekci a diagnostice DNA. Tento projekt je zaměřen na testování různých postupů elektrochemické detekce v analýze genomové DNA amplifikované pomocí PCR. Budeme zkoumat (i) metody zahrnující hybridizaci nukleotidové sekvence PCR produktu se sondami DNA a následnou elektrochemickou detekci bez nebo s použitím značek, nebo (ii) inkorporaci chemicky modifikovaných nukleotidů (značek poskytujících specifické elektrochemické signály) do PCR amplikonů, atd. Vybereme techniky s optimálními analytickými parametry a využijeme je při řešení typických diagnostických problémů - detekci bodových mutací/jednonukleotidových polymorfismů, analýze délky repetitivních sekvencí nebo monitorování genové exprese.
Title	Sequence-specific electrochemical sensing of PCR-amplified genomic DNA fragments (en) Sekvenčně specifická elektrochemická detekce fragmentů genomové DNA amplifikovaných pomocí PCR
skos:notation	GPP206/11/P739
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP206%2F11%2FP739/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP206%2F11%2FP739/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-09 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100993422
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CG - Elektrochemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	PCR electrochemical methods DNA hybridization DNA polymerase DNA labeling magnetic beads SNP repetitive sequences gene expression (en)
http://linked.open...neniPrubehuReseni	Deferred Final Report (en) Odložená závěrečná zpráva (cs)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P206-11-P739
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKPK
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Enzyme-linked electrochemical DNA ligation assay using magnetic beads
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F11%2FP739/2011/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F11%2FP739/2012/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F11%2FP739/2013/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F11%2FP739/2014/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP206%2F11%2FP739/2015/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 82 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software