About: Study of synteny between human, Xenopus tropicalis and Xenopus laevis by fluorescence in situ hybridization

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Study of synteny between human, Xenopus tropicalis and Xenopus laevis by fluorescence in situ hybridization Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP304/07/P204
Description	Xenopus tropicalis, one of the leading organism for study of developmental processes, has recently been adopted for research in genetics and functional genomics. However, there is lack of data concerning genome organization and evolution with respect toallotetraploid counterpart Xenopus laevis and higher vertebrates, including human. This project will be focused on the identification of syntenic groups between Xenopus tropicalis, Xenopus laevis and human by comparative chromosomal hybridization (Zoo-FISH). Painting probes derived from micro-dissected chromosomes of Xenopus tropicalis will serve for hybridization experiments with Xenopus laevis and human metaphase spreads. Conversely, synteny found on human chromosomes will be confirmed and specified by application of commercially available painting probes of respective chromosomes on X. tropicalis preparations. This approach along with in silico comparative gene mapping (database ENSEMBL) can extend and elucidate events during evolution of (en) Xenopus tropicalis patří mezi nejvýznamnější modelové organismy z pohledu studia embryonálního vývoje. V současné době se stále více začíná prosazovat na poli genetiky a funkční genomiky. Většímu rozvoji těchto oblastí však brání malá znalost organizacea evoluce jeho genomu. V navrhovaném projektu zamýšlím řešit tuto problematiku pomocí srovnávací chromozomové hybridizace (Zoo-FISH) mezi X. tropicalis a alotetraploidním, příbuzným druhem X. laevis a mezi X. tropicalis a evolučně vzdáleným člověkem. Laserovou mikrodisekcí připravené malovací sondy pro jednotlivé chromozomy X. tropicalis budou použity na metafázních preparátech pocházejících z X. laevis a člověka. Pozitivní lidské chromozomy obsahující jednu nebo více syntenních oblastí pak budou zpětně hybridizovány na metafázních preparátech X. tropicalis, a to s pomocí komerčně dostupných lidských malovacích sond. Výsledný obraz syntenních chromozomálních oblastí bude doplněn o data ze srovnávacího genového mapování, která jsou volně dostupná
Title	Study of synteny between human, Xenopus tropicalis and Xenopus laevis by fluorescence in situ hybridization (en) Studium syntenie mezi člověkem, Xenopus tropicalis a Xenopus laevis pomocí fluorescenční in situ hybridizace
skos:notation	GP304/07/P204
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP304%2F07%2FP204/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP304%2F07%2FP204/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65825661
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	synteny; Xenopus; human; fluorescence in situ hybridization (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-22 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/304%2F07%2FP204
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	. (en) Plánované cíle projektu byly splněny a byly nebo budou publikovány v zahraničních impaktovaných časopisech (jedna publikace online, druhá přijata po menších úpravách do tisku). (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	synteny Xenopus human
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Preparation of X. tropicalis whole chromosome painting probes using laser microdissection and reconstruction of X. laevis tetraploid karyotype by Zoo-FISH Deep ancestry of mammalian X chromosome revealed by comparison with the basal tetrapod Xenopus tropicalis A genetic map of Xenopus tropicalis
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP304%2F07%2FP204/2007/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP304%2F07%2FP204/2008/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP304%2F07%2FP204/2009/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP304%2F07%2FP204/2010/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 78 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software