About: Electrochemical tools for detection of point mutations and polymorphisms in DNA

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Electrochemical tools for detection of point mutations and polymorphisms in DNA Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP203/08/P598
Description	Within this project we will continue our previous research focused on developing electrochemical tools for DNA hybridisation detection. We will jodidy oligonucleotides with various tags (primarily metal complexes), study thein electrochemical behaviour and use them as signalling probes in DNA hybridization. OsO4 complexes will be used as chemical probes for unpaired and mispaired bases in DNA heteroduplexes. This principle will be utilized in a new technique of detection of point mutations in DNA. For our purposes we will optimise conditions for manipulating with DNA duplexes containing mismatches and AP sites and conditions for their electrochemical and/or immunodetection. We will employ double-surface strategy of DNA hybridisation detection, in which the hybridisation occurs on separated surfaře - paramagnetic beads. This format allows a precise tune of conditions both for hybridisation and detection. It is expected that results of this project will be further utilized in novel diagnostic (en) V rámci navrhovaného projektu chceme navázat na náš předchozí výzkum elektrochemických nástrojů pro detekci hybridizace DNA. Budeme modifikovat oligonukleotidy různými elektrochemicky aktivními značkami (zejména na bázi kovových komplexů), analyzovat jejich elektrochemické chování a využijeme je jako signální sondy při hybridizaci DNA. Dále se budeme zabývat využitím komplexů Os,L jako chemických sond pro chybně spárované a nespárované baze v heteroduplexech DNA a na tomto principu navrhneme metodu detekce bodových mutací v DNA. Pro naše účely budeme optimalizovat podmínky pro manipulaci s duplexy obsahujícími chybné páry a abazická místa a podmínky elektrochemické nebo imunochemické detekce modifikovaných bazí. Při detekci využijeme tzv. dvoupovrchové strategie, kdy proces hybridizace DNA probíhá na samostatném povrchu - paramagnetických kuličkách. Toto uspořádání dovoluje precisní %22vyladění%22 podmínek jak pro hybridizaci tak pro detekci. Předpokládáme, že získané poznatky budou následně
Title	Electrochemical tools for detection of point mutations and polymorphisms in DNA (en) Elektrochemické nástroje pro detekci mutací a polymorfismů v DNA
skos:notation	GP203/08/P598
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP203%2F08%2FP598/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP203%2F08%2FP598/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-03-20 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82382067
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CG - Elektrochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	DNA; DNA hybridisation; point mutations; SNP; polymorphism; detection; electrochemistry (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-04-16 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/203%2F08%2FP598
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02008GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2008-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Tento projekt rozšířil možností použití směsi oxidu osmičelého a dusíkatých ligandů pro potřebu bioanalýzy DNA. Rovněž byly získány nové informace vrahjící nové světlo na mechanismus modifikační reakce. A) Již delší dobu je známo, že Os,bipy reaguje s vysokou selektivitou s  thyminy v jednořetězcové DNA. Ukázali jsme, že Os,bipy si schopnost zachovává i vůči jednotlivým nespárovaným/ (cs) The project broadens possibilities of using reaction mixture of osmium tetroxide and nitrogenous ligands for biopolymers labeling. There were obtained new insights into reaction mechanism and modification reaction   A) We show that reactive mixture OsO4 and bipyridine  is capable of reaction with unpaired / mispaired T even when it is surrounded by adjacent double-strand DNA stretch (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	DNA DNA hybridisation SNP detection point mutations polymorphism
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Detection of abasic sites in DNA by electrochemical, immunoelectrochemical and acoustic methods using OsO4, 2,2,-bipyridine as a probe for unpaired thymine residues Osmium tetroxide complexes as versatile tools for structure probing and electrochemical analysis of biopolymers Sensing mispaired thymines in DNA heteroduplexes using an electroactive osmium marker: towards electrochemical SNP probing
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F08%2FP598/2008/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F08%2FP598/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F08%2FP598/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F08%2FP598/2011/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software