About: Modified oligonucleotides derived from 5´-substituted nucleoside 5´-C-phosphonates: synthesis and hybridization properties

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Modified oligonucleotides derived from 5´-substituted nucleoside 5´-C-phosphonates: synthesis and hybridization properties Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP203/04/P273
Description	Modified oligonucleotides containing the 3´-O-P-CH(R)-5´´ internucleotide linkages derived from 5´-substituted nucleoside 5´-C-phosphonates in the project, and their physico-chemical properties will be studied and the influence of 5´-substitution on hybridization properties will be investigated. Thermodynamic stabilities of complexes of prepared oligonucleotides with natural complementary counterparts will be evaluated as well as stability of modified oligonucleotides towards nucleolytic enzymes. The project also includes (i) the elaboration of synthetic approaches to novel types of 4´- and 5´-substituted 5´-C-phosphonate analogues which will be tested, as a small molecules, for their ability of acting as cytostatic and/or virostatic agents and (ii) synthesis of epimeric pure 4´-and 5´-substituted 5´-C-phosphonate monomers for oligoadenylates (trimers and tetramers) as potential activators of ribonuclease L. (en) V rámci projektu budou připraveny modifikované oligonukleotidy obsahující 3´-O-P-CH(R)-5´´ internukleotidové vazby odvozené od 5´-substituovaných nukleosid-5´-C-fosfonátů, budou určeny jejich chemické a fyzikální vlastnosti a prokázán vliv 5´-substituce na hybridizační vlastnosti oligonukleotidů. Bude zjištěna především termodynamická stabilita komplexů získaných oligonukleotidů s přirozenými komplementárními řetězci a stabilita těchto oligonukleotidů vůči nukleolytickým enzymům. Projekt také zahrnuje (i) vypracování syntetických přístupů k novým typům 4´-a 5´-substituovaných 5´-C-fosfonátových analogů nukleotidů, které budou testovány na cytostatické a virostatické účinky ve spolupráci se zahraničními pracovišti a (ii) syntézu epimerně čistých 4´- a 5´-substituovaných 5´-C-fosfonátových monomerních jednotek pro oligonukleotidovou syntézu. Vybrané adeninové fosfonáty v ribořadě budou využity ke konstukci 2´-5´oligoadenylátů (trimerů a tetramerů) jako potenciálních aktivátorů ribonukleasy L.
Title	Modified oligonucleotides derived from 5´-substituted nucleoside 5´-C-phosphonates: synthesis and hybridization properties (en) Modifikované oligonukleotidy odvozené od 5´-substituovaných nukleosid-5´-C-fosfonátů: syntéza a hybridizační vlastnosti
skos:notation	GP203/04/P273
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP203%2F04%2FP273/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP203%2F04%2FP273/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-10-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	2498007
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CC - Organická chemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2006
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2004
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2007
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02004GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Synthetic approaches leading to new epimeric pure monomeric units, the 2'-deoxynucleoside-5'-C-phosphonates with nucleobases T, CBz, ABz, GDBAM, were elaborated. Novel 4´- and 5´-substituted 5´-C-phosphonate analogs of nucleotides, e.g. 4´-methoxy, 5´-me (en) Byly vypracovány syntetické přístupy k novým epimerně čistým monomerním jednotkám 2'-deoxynukleosid-5'-C-fosfonátům odvozených od nukleobazí T, CBz, ABz, GDBAM. Dále byly připraveny nové 4´- a 5´-substituované 5´-C-fosfonátové analogy nukleotidů, t.j. 4´ (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	2',5'-linked oligo-3'-deoxynucleotide chimeras with chiral alpha-hydroxyphosphonate internucleotide linkage: Improvement of hybridisation selectivity toward RNA? Nucleoside 5'-C-phosphonates: reactivity of the alpha-hydroxyphosphonate moiety Activation of murine RNase L by isopolar 2 '-phosphonate analogues of 2 ',5 ' oligoadenylates Oxidative cleavage of ribofuranose 5-(alpha-hydroxyphosphonates): a route to erythrofuranose-based nucleoside phosphonic acids
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F04%2FP273/2004/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F04%2FP273/2005/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F04%2FP273/2006/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP203%2F04%2FP273/2007/ico%3A61388963

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software