About: Analýza diversity metabolicky aktivních bakterií v kontaminované zemině s využitím isotopového značení a metagenomiky

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Analýza diversity metabolicky aktivních bakterií v kontaminované zemině s využitím isotopového značení a metagenomiky Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP13-20414P
Description	Accurate assessment of microbial diversity and activity and their responses to different stimuli is one of the central goals of microbial ecology. This project aims to employ DNA-stable isotope probing (SIP) and metagenomics to extensively study microbial communities and their functional genes in polychlorinated biphenyl (PCB)-contaminated soil. The overall aim is to discover how shifts in microbial community structure (upon the presence of halophytic plant species, excess of salt, and bioaugmentation) correlate with changes in metabolic activity and hence the removal of PCBs from the soil. In addition to phylogenetic diversity, functional diversity will be analyzed of the genes encoding for dioxygenases involved in the biodegradation of biphenyl and PCBs. The planned experimental design also has an advantage that it will monitor the diversity and abundance of these dioxygenases in response to contamination of a pristine soil. This will help further relate the primary structure of these enzymes with the affinity towards PCBs. (en) Přesné posouzení mikrobiální diversity a aktivity a jejích reakcí na působení různých faktorů je jedním z hlavních úkolů mikrobiální ekologie. V rámci předkládaného projektu budou pomocí metod isotopového značení DNA a metagenomiky studovány mikrobiální komunity a jejich funkční geny v zemině kontaminované polychlorovanými bifenyly (PCB). Hlavním cílem je popsat, jak změny ve struktuře mikrobiálních komunit (v přítomnosti halofytních rostlin, v přebytku soli a po bioaugmentaci) korelují s metabolickou aktivitou a potažmo s odbouráváním PCB ze zeminy. Vedle diversity fylogenetické bude analyzována i funkční diversita dioxygenas, které se podílejí na metabolismu bifenylu a PCB. Experiment umožňuje též sledovat vývoj diversity těchto dioxygenas bezprostředně po kontaminaci zeminy PCB za účelem lepšího porozumění vtahům mezi primární strukturou a substrátovou specificitou těchto enzymů.
Title	Analýza diversity metabolicky aktivních bakterií v kontaminované zemině s využitím isotopového značení a metagenomiky Diversity analysis of metabolically active bacteria in contaminated soil using stable isotope probing and metagenomics (en)
skos:notation	GP13-20414P
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP13-20414P/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP13-20414P/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-09 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100992941
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	microbial diversity, metabolic activity, bioremediation, stable isotope probing, metagenomics (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fakulta potravinářské a biochemické technologie
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-07 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-20414P
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300006
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	DK - Kontaminace a dekontaminace půdy včetně pesticidů EH - Ekologie - společenstva
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBK
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	microbial diversity bioremediation metabolic activity stable isotope probing
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Identification and characterization of bacteria with bioremediation potential: from cultivation to metagenomics
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP13-20414P/2013/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP13-20414P/2014/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP13-20414P/2015/orjk%3A22330

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 82 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software