| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - Introduction of next-generation sequencing technologies has opened a new era in population genetics, allowing for rapid and inexpensive collection of genome-wide sequence data even for non-model species. Here, we propose to use 454 sequencing to study history of speciation and patterns of hybridization in two non-model organisms: hybrid complex of spined loaches and two hybridizing species of nightingales. Both groups lay on opposite extremes of potential hybridization outcomes: while in nightingales the Mendelian hybrids mediate gene flow between the species, hybridization in spined loaches leads to asexuality. We will sequence cDNA from multiple somatic and germinal tissues from several individuals of each species. The obtained data will help us to understand several fundamental questions about speciation, including the role of sex chromosomes in reproductive isolation or the origin of sexual species from asexual hybrid lineages. Moreover, our data will enable us to identify candidate speciation genes, which can provide new insights into the genetic underpinnings of speciation. (en)
- Zavedení sekvenačních technologií další generace otevřelo novou éru v populační genetice. Nové metody umožňují rychlé a levné sekvenování celých genomů či transkriptomů i u nemodelových organismů. V tomto projektu navrhujeme použít metodu 454 sekvenování za účelem studia historie speciace a hybridizace u dvou organismů: hybridního komplexu sekavců a dvou hybridizujících druhů slavíků. Obě skupiny představují opačné extrémy, co do možných výstupů hybridizace: zatímco u slavíků zprostředkovávají mendelovští hybridi genový tok mezi druhy, u sekavců hybridizace vede k vývoji asexuality. V rámci projektu osekvenujeme cDNA ze somatických a germinálních tkání několika jedinců každého studovaného druhu. Získaná data nám pomohou objasnit několik důležitých otázek týkajících se speciace jako je například úloha pohlavních chromosomů v reprodukční izolaci či vznik sexuálních druhů z klonálních hybridních linií. Kromě toho nám získaná data pomohou identifikovat kandidátní speciační geny, což může přinést nový vhled do genetické podstaty speciace.
|
| Title
| - Inferring the history of speciation from genome-wide population data: lessons from spined loaches and nightingales (en)
- Zjišťování historie speciace z populačních genomových dat: lekce od sekavců a slavíků
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - 454 sequencing population genomics speciation hybridization spined loaches nightingales (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Během řešení projektu byly publikovány celkem 4 vědecké práce, z nich 3 lze považovat za mimořádně kvalitní, neboť jejich IF přesahuje hodnotu 3. (cs)
- Altogehter 4 scientific papers have been published during the projekt and three of them with IF over value 3. (en)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)