About: Characterization of the mitoproteome of the parasitic protist Trypanosoma brucei by means of recombinogenic engineering

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Characterization of the mitoproteome of the parasitic protist Trypanosoma brucei by means of recombinogenic engineering Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/12/2261
Description	Research on the single mitochondrion (mt) of the disease-causing parasite Trypanosoma brucei has revealed several biological oddities such as an expansive DNA network, byzantine RNA metabolism famously involving RNA editing. The organelle switches from a fully functional state in the insect-dwelling stage to a greatly reduced one in the pathogenic stage infecting the mammalian host. Several problems such as how the manifold steps required for expression of mt genes are spatially and temporally coordinated plus what is the shape of the mitoproteome between the two major life stages have yet to be solved. To address these and other questions, we propose to fluorescently tag up to 200 mt proteins to determine their sub-organellar and potential differential interstagial localization using the cutting edge techniques of recombinogenic engineering and super resolution microscopy. This project also aims to establish this platform for addressing the bigger question of the function of more than half of unknown proteins that comprise the whole T. brucei proteome. (en) Studium jediné mitochondrie v buňce závažného parazita Trypanosoma brucei odhalilo řadu zvláštností, jako je rozsáhlá síť mitochondriální (mt) DNA, extrémně složitý metabolismus RNA zahrnující známé editování RNA. Během životního cyklu se plně funkčního organela ve stádiu v hmyzím vektoru změní na velmi redukovanou mitochondrii, charakteristickou pro patogenní stádium v krvi savčího hostitele. Série kroků vedoucích k expresi mt genů vyžaduje časovou a prostorovou koordinaci, o níž však dosud není nic známo. Podobně zatím nebyl studován mitoproteom přechodného stádia. Pro zodpovězení těchto a dalších otázek chceme označit fluorescenční značkou až 200 mt bílkovin, což prostřednictvím nejmodernějších metod rekombinantní technologie a mikroskopie s vysokým rozlišením umožní určit jejich suborganelární lokalizaci a případné rozdíly mezi životními stádii. Cílem tohoto projektu je rovněž vytvořit efektivní platformu pro zodpovídání otázek týkajících se funkcí více než poloviny bílkovin tvořících proteom T. brucei, o nichž dosud není nic známo.
Title	Characterization of the mitoproteome of the parasitic protist Trypanosoma brucei by means of recombinogenic engineering (en) Charakterizace mitoproteomu parazitického prvoka Trypanosoma brucei metodou rekombinírování
skos:notation	GAP305/12/2261
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F12%2F2261/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F12%2F2261/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-05-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100894751
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	trypanosoma mitochondria proteome recombineering sleeping sickness (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P305-12-2261
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	The goal of the project was the investigation of mitoproteome of a model organism Trypanosoma brucei using a protein fluorescent tagging to determine their sub-organellar localization. Experimental difficulties lead to rephrasing of the project to a smaller set of mitochondrial proteins. This approach was well justified and resulted in publication of 7 original papers in impacted journals. (en) Cílem projektu bylo prozkoumat mitoproteom modelového organizmu Trypanosoma brucei s použitím metody fluorescenčního značení proteinů pro jejich sub-organelární lokalizaci. Nicméně experimentální obtíže vedly k přeformulování projektu na menší soubor mitochondriálních proteinů. Tento postup je dobře zdůvodněn a ve svém výsledku vedl k publikaci sedmi článků v impaktovaných časopisech. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Dynamics of Mitochondrial RNA-Binding Protein Complex in Trypanosoma brucei and Its Petite Mutant under Optimized Immobilization Conditions A Core MRB1 Complex Component Is Indispensable for RNA Editing in Insect and Human Infective Stages of Trypanosoma brucei Dual core processing: MRB1 is an emerging kinetoplast RNA editing complex Mitochondrial translation factors of Trypanosoma brucei: elongation factor-Tu has a unique subdomain that is essential for its function Comparative analysis of respiratory chain and oxidative phosphorylation in Leishmania tarentolae, Crithidia fasciculata, Phytomonas serpens and procyclic stage of Trypanosoma brucei Trypanosome Letm1 protein is essential for mitochondrial potassium homeostasis
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F2261/2015/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F2261/2012/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F2261/2013/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F2261/2014/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software