About: Mitochondrial DNA genetics in relation to mitochondrial network dynamics and pathogenesis

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Mitochondrial DNA genetics in relation to mitochondrial network dynamics and pathogenesis Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/12/1247
Description	We will apply 3D imaging by the 4Pi (100 nm 3D resolution) and a novel Biplane FPALM microscopy (30 nm 3D resolution) to advance our knowledge of nucleoids of mitochondrial DNA (mtDNA, clusters of several molecules circular mtDNA and maintenance and executive proteins). Also STED microscopy of immunohistochemical samples (~50 nm 2D resolution) and a conventional confocal time-lapsed microscopy of living model cells will be employed. Mt nucleoids will be visualized by lentivirally transfected conjugates of photoconvertible fluorescent proteins (Eos, Dendra2, PAmCherry, and PA-CFP2) with nucleoid proteins (TFAM, ATAD3, Twinkle helicase, mtSSB, TFBM, mTERF). We will distinct between resting, transcription, and replicative states of mt nucleoids, investigate their redistribution in relation to fission/fusion of mitochondrial network and during cell division, as well as their internal structure, with the regard to mt genetics and selected pathogenic states. The world unique Biplane FPALM microscope built jointly in cooperation with Yale University will be employed to advance the field. (en) 3D 100nm/30nm rozlišující 4Pi a BiplaneFPALM mikroskopií, případně 2D STED a časovým konfokálním monitorováním rozlišíme mezi klidovým, transkripčním a replikačním stavem nukleoidů mitochondriální DNA (mtDNA), tedy komplexů několika molekul dvoušroubovicové cirkulární mtDNA a proteinů. Vizualizaci založíme na fluorescenčních a fotokonvertibilních proteinech (Eos, Dendra2, PAmCherry, a PA-CFP2) fúzovaných s proteiny nukleoidů (TFAM, ATAD3, Twinkle helikáza, mtSSB, TFBM, mTERF) případně na imunohistochemii u STED, u vybraných modelových buněk lentivirálně transfekovaných připravenými konstrukty. Prozkoumáme redistribuci mt nukleoidů ve vztahu k dezintegraci a fúzi mitochondriální sítě a buněčnému dělení ve vztahu mezi mateřskou a dceřinou buňkou; a rovněž vnitřní morfologii mt nukleoidů ve vztahu k hybridním strukturám DNA/RNA, výše zmíněným klidovým, transkripčním a replikačním stavům, a vybraným patologickým situacím. Nejméně prostudovaná část buněčné biologie tak bude prozkoumána na světově unikátním zařízení BiplaneFPALM mikroskopu zkonstruovaném ve spolupráci s Yale University.
Title	Mitochondrial DNA genetics in relation to mitochondrial network dynamics and pathogenesis (en) Genetika mitochondriální DNA ve vztahu k dynamice mitochondriální sítě a patogeneze
skos:notation	GAP305/12/1247
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F12%2F1247/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F12%2F1247/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100777482
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	nucleoids at transcription and replication of mtDNA heteroplasmy mtDNA redistribution upon cell division (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P305-12-1247
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EA - Morfologické obory a cytologie ED - Fyziologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBB
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Distribution of mitochondrial nucleoids upon mitochondrial network fragmentation and network reintegration in HEPG2 cells Disrupted ATP synthase activity and mitochondrial hyperpolarisation-dependent oxidative stress is associated with p66Shc phosphorylation in fibroblasts of NARP patients Antioxidant and regulatory role of mitochondrial uncoupling protein UCP2 in pancreatic beta-cells Import of desired nucleic acid sequences using addressing motif of mitochondrial ribosomal 5S-rRNA for fluorescent in vivo hybridization of mitochondrial DNA and RNA
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F1247/2012/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F1247/2013/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F1247/2014/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F1247/2015/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F12%2F1247/2016/ico%3A67985823

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 82 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software