About: Evolution of parasitism:analysis of genomes and key physiological functions of free-living Mastigamoeba balamuthi and pathogenic Entamoeba histolytica

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Evolution of parasitism:analysis of genomes and key physiological functions of free-living Mastigamoeba balamuthi and pathogenic Entamoeba histolytica Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/11/1061
Description	In this project we propose a comparative genomic study of free-living protists Mastigamoeba balamuthi and its parasitic relative Entamoeba histolytica. Analyses of genome sequences of free-living relatives of parasitic species are critical for understanding of evolution of parasitism. We expect that comparison of proposed genomes might allow to identify which genome components have been lost and which changes have contributed to the reductive evolution of the genome in relation to parasitism. We might also identify features of parasitic genomes that are related to their free-living ancestry, modifications of ancestral genes facilitating novel function related to adaptations to new niches as well as acquisition of novel genes involved in parasite-host relationship and pathogenicity.The study includes (i) determination of a genome sequence of M. balamuthi and its bioinformatic comparison with the genome sequence available for E. histolytica, and (ii) comparative studies of selected cellular functions that might be associated with a transition of a free-living to parasitic lifestyle. (en) Projekt je zaměřen na studium evoluce parazitismu s využitím modelu volně žijící améby Mastigamoeba balamuthi a příbuzného lidského patogena Entamoeba histolytica. Srovnávací genomika volně žijících a příbuzných parazitických druhů je esenciální pro pochopení evoluce parazitismu a v důsledku i buněčných funkcí parazitických organismů. Očekáváme, že navrhovaná studie umožní identifikovat komponenty genomu, které vymizely během adaptace volně žijících organismů k parazitickému způsobu života, modifikace ancestrálních genů, které nabyly u parazitů nové funkce i získání zcela nových genů v souvislosti s parazitismem a patogenitou. Studie zahrnuje (i) sekvenaci genomu M. balamuthi, jeho bioinformatickou analýzu a porovnání s genomem E. histolytica, který je dostupný a (ii) srovnávací studium vybraných buněčných funkcí, k jejichž změnám došlo v souvislosti s tranformací volně žijících na parazitické organismy, zejména redukce mitochondrie, modifikace vesikulárního transportu a způsobu pohybu (ztráta bičíku, rozvoj amébovitého pohybu).
Title	Evolution of parasitism:analysis of genomes and key physiological functions of free-living Mastigamoeba balamuthi and pathogenic Entamoeba histolytica (en) Evoluce parazitismu: analýza genomů a klíčových fyziologických funkcí volně žijící améby Mastigamoeba balamuthi a patogena Entamoeba histolytica
skos:notation	GAP305/11/1061
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F11%2F1061/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F11%2F1061/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100773101
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	genome parasite mastigamoeba entamoeba evolution (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-07-02 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P305-11-1061
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBBK
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	NIF-type iron-sulfur cluster assembly system is duplicated and distributed in the mitochondria and cytosol of Mastigamoeba balamuthi
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2011/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2011/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2012/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2012/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2013/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2013/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2014/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2014/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2015/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1061/2015/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software