About: Development of CpG methylation of HIV-1 promoter and its stabilizing effect on the latent provirus reservoir: longitudinal study in patients

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Development of CpG methylation of HIV-1 promoter and its stabilizing effect on the latent provirus reservoir: longitudinal study in patients Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP304/12/1736
Description	Existence of latent HIV-1 reservoir makes the eradication of HIV-1 infection unreal. DNA methylation of retroviral 5' long terminal repeat (LTR) is one of the mechanisms of latency maintenance. In our previous work we have shown that CpG methylation of the 5' LTR tightly controls resistance of latent HIV-1 to reactivation and thus determines the stability of the HIV-1 latency (Blazkova et al., 2009). However, even dense methylation of the 5' LTR did not confer complete resistance to reactivation with some histone deacetylase inhibitors and cellular activators. In our clinical longitudinal study we will analyze the HIV-1 CpG methylation dynamics directly in the latent reservoir of infected patients and we will analyze the reservoir reactivation ex vivo. The specific aims of our project are to characterize the development of CpG methylation of HIV-1 promoter in the latent reservoir during antiviral therapy, and to characterize the effects of CpG methylation on stability of the reservoir against reactivation signals. Our clinical study explores the possible HIV-1 therapeutic strategy. (en) Latence proviru HIV-1 v rezervoáru znemožňuje eliminaci HIV-1 infekce u pacientů pomocí antivirové léčby. Methylace DNA oblastí retrovirového promotoru a enhanceru, umístěných v repetici na 5' konci (5' LTR), je jedním z mechanizmů zajišťujících udržení latence u pacientů. V předchozí práci jsme prokázali, že methylace CpG v 5' LTR HIV-1 zvyšuje rezistenci latentního HIV-1 vůči reaktivaci a tak určuje stabilitu latence viru HIV-1 (Blazkova et al., 2009). Nicméně ani hustá methylace 5' LTR HIV-1 nepotlačuje úplně reaktivaci HIV-1 při použití některých inhibitorů histon deacetyláz a buněčných aktivátorů. V klinické longitudinální studii se chceme zabývat dynamikou methylace CpG HIV-1 přímo v latentním rezervoáru pacientů a chceme určit schopnost reaktivace tohoto rezervoáru ex vivo. Konkrétní cíle naší práce jsou charakterizace vývoje methylace CpG HIV-1 v latentním rezervoáru pacientů během antiretrovirové léčby a charakterizace vlivu methylace CpG na stabilitu tohoto rezervoáru vůči reaktivaci. Tato klinická studie se zabývá možnými terapeutickými strategiemi eliminace HIV-1.
Title	Development of CpG methylation of HIV-1 promoter and its stabilizing effect on the latent provirus reservoir: longitudinal study in patients (en) Vývoj methylace CpG promotoru HIV-1 a její vliv na stabilizaci latentního rezervoáru proviru: longitudinální studie u pacientů
skos:notation	GAP304/12/1736
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP304%2F12%2F1736/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP304%2F12%2F1736/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100782416
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	HIV-1 reservoir in patients longitudinal prospective study proviral latency proviral reactivation CpG methylation chromatin structure (en)
http://linked.open...neniPrubehuReseni	Deferred Final Report (en) Odložená závěrečná zpráva (cs)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P304-12-1736
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRP
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKP
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP304%2F12%2F1736/2015/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP304%2F12%2F1736/2016/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP304%2F12%2F1736/2012/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP304%2F12%2F1736/2013/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP304%2F12%2F1736/2014/ico%3A68378050

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software