About: The role of RNA chaperone Hfq and small RNAs in physiological fitness and virulence of Bordetella pertussis     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • The stress-induced small regulatory RNAs (sRNAs) typically function by base-pairing with target mRNA and thereby affect the translational efficiency of target mRNA. Hfq, a bacterial RNA chaperon, facilitates these sRNA/mRNA interactions.  The aim of this project is to elucidate the roles of Hfq and sRNAs in physiological fitness and in virulence of pathogenic Bordetella pertussis.The function of Hfq in B. pertussis will be analyzed by construction of an hfq mutant and by comparison of the hfq+/hfq- expression patterns by means of microarray and proteomics. Next, we will perform genome-wide search for sRNAs in B. pertussis using bioinformatics, RNomics, and microarray analysis. We will attempt to identify genes, which expression will be modulated by identified sRNAs in our screens, especially those involved in survival under stress conditions and in virulence. This complex approach will allow us to evaluate the impact of Hfq and identified sRNAs on physiology and pathogenicity of B. pertussis. (en)
  • Malé regulační RNA (sRNA) se díky své komplementaritě váží k cílové mRNA a ovlivňují účinnost její translace. Hfq, bakteriální RNA chaperon, je díky svým RNA-vazebným vlastnostem důležitým prostředníkem těchto RNA-RNA interakcí a hraje také důležitou úlohu ve virulenci patogenních bakterií. Cílem tohoto projektu je zjistit jakou roli hraje Hfq protein a sRNA ve virulenci  gram-negativní patogenní baktérie Bordetella pertussis, původce černého kašle. Funkci Hfq v tomto mikroorganizmu budeme sledovat porovnáním genové exprese ve wt a hfq mutantu pomocí microarray  a proteomové analýzy. Tyto experimenty nám umožní identifikovat geny, jejichž exprese je regulována Hfq. Dalším cílem bude identifikace sRNA v kmenech B. pertussis kombinací různých přístupů a metod včetně bioinformatiky, RNomiky a microarray analýzy. Získané informace budou vyhodnoceny s cílem získat ucelenou představu o identifikovaných sRNA, jim iregulovaných mRNA a také o roli, kterou pro jejich interakci hraje Hfq protein.
Title
  • The role of RNA chaperone Hfq and small RNAs in physiological fitness and virulence of Bordetella pertussis (en)
  • Role RNA chaperonu Hfq a regulačních sRNA ve fyziologii a virulenci Bordetella pertussis
skos:notation
  • GAP302/11/1940
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • Hfq sRNA post-transcriptional regulation virulence Bordetella (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...tniCyklusProjektu
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 46 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software