About: Morphogenesis of the genome during early embryonic development of C. elegans

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Morphogenesis of the genome during early embryonic development of C. elegans Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP302/11/1262
Description	The morphogenesis of the genomeis the process whereby linear genetic information folds into a complex three-dimensional shape in the cell nucleus. We hypothesize that this folding proceeds along reproducible patterns during development and cell differentiation. This hypothesis will be tested by analyzing the spatial positioning of co-regulated loci in the early C. elegans embryo,a model that is ideally suited for this purpose because of its invariant cell lineage and synchronous development from individual to individual. The positioning of genes in the C. elegans embryonic cell nuclei will be determined using multicolor 3D DNA FISH and live cell imaging. The imaging data will be analyzed using pattern recognition algorithms. Finally, the developmental significance of gene positioning patterns will be explored using the well-characterized glp-1/Notch cell fate mutant. The finding of reproducible patterns of spatial gene positioning during early embryogenesis would open new avenues of research on genome function and gene regulation. (en) Morfogeneze genomu je proces, jímž se skládá v buněčném jádře lineárně uložená genetická informace do komplexního trojrozměrného uspořádání. Předpokládáme, že k tomuto skládání dochází reprodukovatelně během vývoje a diferenciace buňky. Tato hypotéza bude testována analýzou prostorového rozmístění vzájemně regulovaných chromozomálních ložisek v raném embryu C.elegans. To představuje ideální model pro tento účel díky invariantnímu rodokmenu C. elegans a synchronnímu vývoji jednotlivých embryí. Prostorové rozmístění genů v jádře embryonální buňky C. elegans bude určeno v živých buňkách vícebarevnou 3D DNA FISH. Získaná data budou analyzována algoritmy pro rozpoznávání vzorů. Vývojová signifikance charakteru genového rozmístění bude zkoumána pomocí dobře definovaného „cell fate“ mutanta glp-1/Notch. Nalezení reprodukovatelných typů genového uspořádání v průběhu rané embryogeneze by otevřelo nové cesty výzkumu organizace genomu a genové regulace.
Title	Morphogenesis of the genome during early embryonic development of C. elegans (en) Morfogeneze genomu v raných vývojových stádiích C. elegans
skos:notation	GAP302/11/1262
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP302%2F11%2F1262/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP302%2F11%2F1262/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-07-01 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100268826
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	nuclear architecture 3D gene positioning C. elegans embryogenesis live cell imaging (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	2. lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P302-11-1262
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2013
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2013-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	The aims of the project have been fulfilled and allowed to create tools for the study of spatial arrangement of nuclear chromatin in early embryo of C. elegans. The results were published in Plos One and Methods Mol Biol. Other results were published 1 journal and submitted to BMC Dev Biology. (en) Cíle projektu byly splněny a umožnily vytvořit nástroje pro studium prostorového uspořádání jádrového chromatinu časných embryí C. elegans. Vytvořený protokol byl publikován v Methods Mol Biol, originální v Plos One. Přehledný článek byl otištěn v recenzovaném časopisu Médicine/Scinece Amérique, další článek byl odeslán do BMC Dev Biology. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Microscopic analysis of chromatin localization and dynamics in C. elegans Gene regulation in three dimensions Nucleologenesis in the Caenorhabditis elegans Embryo
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP302%2F11%2F1262/2011/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP302%2F11%2F1262/2011/orjk%3A11130 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP302%2F11%2F1262/2012/orjk%3A11130 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP302%2F11%2F1262/2013/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP302%2F11%2F1262/2013/orjk%3A11130 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP302%2F11%2F1262/2014/orjk%3A11110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 121 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software