| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - Understanding the key molecular players in bacteria is crucial for the development of novel antibacterial compounds. RNA polymerase (RNAP) is essential for gene expression. Recently, we have solved the structure of the delta subunit of RNAP from Bacilus subtilis and unraveled its cellular role. In the course of these studies we identified a protein interacting with delta as well as other proteins interacting with RNAP. Here, we propose to study the structure-function relationship of RNAP from Bacillus subtilis with the following proteins: (i) omega1, a subunit of RNAP of which little is known; (ii) TRAP, an extensively studied protein involved in amino acid metabolism whose interaction with RNAP was previously unsuspected; (iii) SP_2234, a protein of unknown function that we identified to interact with delta; and (iv) Yvgs, a putative helicase that we identified to interact with RNAP. The proposed project will investigate the physiological role(s) of interactions of these proteins with RNAP by biochemical, genetic, and structural approaches. The project will advance our understanding of RNAP as a hub where various types of signals converge, are interpreted, and affect the transcriptional output. The new knowledge may aid in designing novel antibacterial compounds targeting RNAP and its function. (en)
- Porozumění molekulárnímu aparátu bakteriální buňky je klíčové pro vývoj nových antibakteriálních látek. RNA polymeráza (RNAP) je esenciální pro genovou expresi. V současnosti jsme vyřešili strukturu podjednotky delta RNAP a objasnili její fyziologickou roli. V průběhu těchto studií jsme identifikovali proteiny, které interagují s touto podjednotkou nebo s bakteriální RNAP. V tomto projektu navrhujeme studovat strukturně-funkční vztahy těchto proteinů: (i) omega1, dosud nestudovaná podjednotka RNAP; (ii) TRAP, extenzivně studovaný protein jehož přítomnost na RNAP nebyla dosud popsána a jenž jsme identifikovali na RNAP; (iii) SP_2234, protein o neznámé funkci, který jsme identifikovali jako interakčního partnera podjednotky delta; (iv) YvgS, helikázu, kterou jsme identifikovali jako vázající se na RNAP. Navrhovaný výzkum bude zaměřen na určení fyziologické role interakcí těchto proteinů s RNAP za použití biochemických, genetických a strukturních přístupů. Tento projekt prohloubí naše znalosti o RNAP jako molekule, kde konvergují různé signály, jsou interpretovány, a ovlivňují transkripční výstup. Nové znalosti získané v tomto projektu mohou pak pomoci při vývoji nových antibakteriálních látek zacílených na RNAP.
|
| Title
| - RNA polymerase: The “meeting point” of regulatory networks (en)
- RNA polymeráza: Průsečík regulačních sítí
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - RNA polymerase gene expression interaction partners protein structure (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Project was focused on functional evaluation of newly identified factors interacting with RNA polymerase. The data in final report are valid and adequate. This project significantly increased our knowledge about bacterial TFs and transcription in general. There were 8 papers in prestigious journals with IF. Řešení projektu a čerpání prostředků bylo v souladu s pravidly. (en)
- Projekt byl zaměřen na objasnění funkce nově identifikovaných faktorů interagujících s RNA polymerázou. Údaje na závěrečné kartě projektu jsou validní a adekvátní. Tento projekt významně rozšířil naše znalosti o bakteriálních transkripčních faktorech i transkripci obecně. Výsledky byly publikovány v odborných časopisech, 8x s IF Řešení projektu bylo v souladu s pravidly. (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)