| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - Fyzikálně korektní popis mezimolekulových interakcí je zcela zásadní pro pochopení struktury a vlastností biologicky relevantních systémů, jako jsou např. DNA, RNA a proteiny. Interakce v těchto systémech jsou dány jemnou rovnováhou disperzních, elektrostatických a výměnných sil, kterou běžně používané kvantově chemické metody založené na lokálních funkcionálech hustot (LDA, GGA metody) nedokáží popsat. Četné příklady selhání DFT výpočtů lze najít v organických (aromatických) krystalech nebo grafitických nanomateriálech s intermolekulárními π-π interakcemi. Jedno z možných řešení výše zmíněného problému představuje DFT/CC korekční metoda vyvinutá na našem pracovišti (O. Bludský et al., J. Chem. Phys., 128, 114102 (2008)). Tato metoda umožňuje velmi přesný popis π-π interakcí v molekulových krystalech a byla již úspěšně testována na řadě teoreticky i experimentálně dobře prostudovaných systémů (grafit, benzen, C60). Projekt "Studium mezimolekulových interakcí v molekulových krystalech a proteinech" bude zaměřen na využití DFT/CC metody pro řadu modelových systémů. Výsledky těchto studií budou poté aplikovány pro charakterizaci mezimolekulových interakcí proteinů.
- Interactions in molecular solids display an intricate balance between dispersion, electrostatic, and exchange forces. This situation is not particularly favorable for the widely used density functional theory (DFT) approaches employing the local density functionals (LDA, GGA). DFT calculations typically fail to describe dispersive (van der Waals) molecular systems. Many examples occur in organic (aromatic) crystals and graphitic nanomaterials with intermolecular π-π interactions. A proper description of the π-π stacking interactions is also essential for many biologically relevant molecules (e.g. DNA, RNA, proteins). Recently, a novel DFT/CC correction scheme has been proposed in our laboratory for precise calculations of weakly bound molecular solids (O. Bludsky et al., J. Chem. Phys., 128, 114102 (2008)). The DFT/CC method was tested for well-studied systems, both from the theoretical and experimental point of view. The main emphasis of this project is to develop theoretical methods for precise description of intermolecular interactions in molecular solids, and, in turn, from an accurate parameterization of the DFT/CC correction scheme obtain valuable information on interactions in proteins. (en)
|
| Title
| - Studium mezimolekulových interakcí v molekulových krystalech a proteinech
- Intermolecular Interactions in Molecular Solids and Proteins (en)
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - intermolecular interactions proteins (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Project devoted to the design of theoretical models and methods of intermolecular interactions in complex molecular systems was completed according to the plan. It provided significant results in methodology and applications, particularly description of weakly bound molecular systems and biomolecular interactions. The results were published in 10 papers in impacted journals and one book chapter. (en)
- Projekt zabývající se vývojem teoretických modelů a metod mezimolekulových interakcí v komplexních molekulových systémech byl řešen v souladu s plánem. Byly dosaženy významné výsledky v oblasti metodologické i aplikační, zejména v popisu slabě vázaných molekulových systémů a biomolekulárních interakcí. Výsledky byly shrnuty v 10 publikacích v impaktovaných časopisech a v jedné kapitole v knize. (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)