About: The role of small ORFs in the pathogenesis of porcine circovirus 2 diseases

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The role of small ORFs in the pathogenesis of porcine circovirus 2 diseases Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA524/09/0673
Description	The main objective of the project is to evaluate the role of small ORFs in the pathogenesis of circovirus associated diseases in swine. We expect that gene products of one or more of these ORFs are expressed in vivo and contribute to the development of clinical manifestation of the disease. Sequencing of field strains originating from subclinical and different clinical PCVD cases thus could help to answer this question. Expression of gene products of these ORFs will also be monitored by isolation of these strains on PK-15 cell line and subsequent evaluation of mRNA expression by quantitative PCR and 2D electrophoresis. The ability of these viruses to induce apoptosis will be used as the marker of virulence. Expression of these ORFs during natural infection will likely be accompanied by the production of specific antibodies. This is why we plan to express all putative ORFs as recombinant proteins and to evaluate timing of seroconversion and possible correlation between this serological response and protectivity. Further the role of small ORFs in vitro will be evaluated by studies on tissue cultures experimentally infected with infectious molecular clones with deleted small ORFs. The ability to induce clinical form of PCVD in inoculated piglets will be considered as the marker of virulence. (en) Hlavním cílem projektu je určit vliv malých otevřených čtecích rámců na patogenezi různých forem cirkovirového onemocnění prasat. Genové produkty těchto čtecích rámců jsou pravděpodobně exprimovány in vivo a přispívají k rozvoji klinických příznaků onemocnění. Ačkoliv je genom cirkovirů pozoruhodně konzervovaný, zdá se, že malé genetické změny umožní diferenciaci kmenů viru dle jejich virulence. Bodové mutace mohou přispívat ke vzniku start i stop kodonů, což ovlivní i expresi malých čtecích rámců. Sekvenování dostatečného počtu terénních kmenů viru pocházejících z různých klinických forem onemocnění PCVD může zodpovědět tuto otázku. Exprese těchto čtecích rámců bude monitorována izolací kmenů viru na buněčné linii PK-15 a následně sledováním exprese mRNA kvantitativní RT-PCR a 2D elektroforézou. Schopnost těchto kmenů viru indukovat apoptózu bude použita jako metoda kvantifikace virulence. Exprerse těchto čtecích rámců během přirozené infekce bude pravděpodobně doprovázena tvorbou specifických protilátek. proto plánujeme expresi všech pravděpodobných malých čtecích rámců a sledování nástupu sérokonverze a korelaci mezi touto sérokonverzí a nástupem protektivní imunitní odpovědi. Dále bude role malých čtecích rámců posuzována pomocí infekčních molekulárních klonů s deletovanými start kodony (nebo inkorporovanými stop kodony) malých čtecích rámců. Markerem virulence bude schopnost vyvolat klinickou formu onemocnění.
Title	The role of small ORFs in the pathogenesis of porcine circovirus 2 diseases (en) Role malých ORF v patogenezi cirkovirových onemocnění prasat
skos:notation	GA524/09/0673
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA524%2F09%2F0673/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA524%2F09%2F0673/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-01-30 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	92539167
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	circovirus; open; reading; frames; pathogenesis; pig (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fakulta veterinárního lékařství
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2012-03-30 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/524%2F09%2F0673
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2012
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2013
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02009GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2012-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2009-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Výsledky projektu přispěly k poznání a analýze malých čtecích rámců cirkoviru prasat PCV2 a vyloučení jejich role v cirkovirovém onemocnění prasat. Možným faktorem těchto infekcí je pravděpodobně koinfekce s TT virem prasat. (cs) The results of this project have contributed to the understanding and analysis of small reading frames of circovirus PCV2 and exclusion of their role in circomavirus diseases in pigs. A possible factor of these infections is probably the co-infection with TT swine virus. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	frames open pathogenesis reading circovirus
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Prevalence and age distribution of porcine torque teno sus virus (TTSuV) in the Czech Republic Expression and serological reactivity of Nsp7 protein of PRRS genotype I virus Cirkovirové infekce v roce 2009 Preliminary epitope mapping of Torque teno sus virus 1 and 2 putative capsid protein and serological detection of infection in pigs
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA524%2F09%2F0673/2009/orjk%3A16170 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA524%2F09%2F0673/2010/orjk%3A16170 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA524%2F09%2F0673/2011/orjk%3A16170 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA524%2F09%2F0673/2012/orjk%3A16170 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA524%2F09%2F0673/2013/orjk%3A16170

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 82 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software