About: A study of chromosome regions and genes affecting fat accretion in pigs

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: A study of chromosome regions and genes affecting fat accretion in pigs Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA523/07/0353
Description	The objective of this project is to contribute to international endeavour focused on finding genes underlying porcine variability in fat deposition . This is important for the pig industry to produce healthier (low fat content in carcass) and consumer acceptable (2 - 3% intramuscular fat) pork and for the pig as a model animal for study of human obesity. Fat deposition is quantitative trait influenced by genetic (quantitative trait loci - QTLs) and environmental factors. The whole genome QTL mapping and association studies performed by us and other groups in Meishan x Western breed crosses revealed QTLs for fat accretion on chromosome X (SW259 - SW1943), on q arm of the chromosome 2 (RETN) and on chromosome 13 (ADIPOQ). We will perform partial cloning of selected genes from homologous human chromosome regions and their linkage mapping in USDA MARC backcross pedigree. For a more detailed QTL mapping we perform association analysis of genes located within regions, in a cohort of 1, 000 crosses (en) Cílem toho projektu je přispět k mezinárodnímu úsilí zaměřenému na identifikaci genů kontrolujících ukládání tuku. Je to důležité jak pro výrobu zdravějšího vepřového masa (nižším obsah tuku v jatečním těle) vyhovujícího požadavkům konzumentů (2-3% nitrosvalového tuku), tak z hlediska využití prasete jako modelového zvíře pro studium genetiky lidské obesity. Ukládání tuku je kvantitativní vlastnost, která je ovlivňována genetickými vlivy (lokusy kvantitativních znaků - QTL) a vlivy prostředí. Námi a jinými skupinami provedené celogenomové mapování QTL a asociační studie u kříženců plemene Meishan se Západními plemeny identifikovaly QTL pro ukládání tuku na chromozómu X (SW259 - SW1943), na q raménku chromozomu 2 (RESTN) a na chromozómu 13 (ADIPOQ). Provedeme parciální klonování vybraných genů z homologních lidských chromozómových úseků a jejich vazbové mapování na USDA MARC referenční rodině. Za účelem detailního QTL mapování provedeme asociační studii výše zmíněných genů u kohorty 1 000
Title	A study of chromosome regions and genes affecting fat accretion in pigs (en) Studium chromozómových oblastí a genů ovlivňujících ukládání tuku u prasat
skos:notation	GA523/07/0353
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA523%2F07%2F0353/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA523%2F07%2F0353/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65679465
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	GI - Šlechtění a plemenářství hospodářských zvířat
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	QTL; fat accretion; SSCX; SSC2; resistin; adiponectin; pig (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	5 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	5 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-22 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/523%2F07%2F0353
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	. (en) Panel doporučuje hodnotit jako splněno, cíle byly splněny a byly publikovány ve 3 článcích v časopisech s IF. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	QTL SSC2 SSCX adiponectin fat accretion resistin
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Genome-wide mapping of Quantitative Trait Loci for fatness, fat cell characteristics and fat metabolism in three porcine F2 crosses Porcine insulin receptor substrate 4 (IRS4) gene: cloning, polymorphism and association study The visfatin (NAMPT; PBEF1) gene polymorphisms and associations with meat performance traits in three pig breeds kept in the Czech Republic Porcine NAMPT gene: search for polymorphism, mapping and association studies Mapping of QTL on chromosome X for fat deposition, muscling and growth traits in a wild boar x Meishan F2 family using a high-density gene map
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2007/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2007/ocs%3AUS%3AUSDA+ARS http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2007/orjk%3A43210 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2008/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2008/orjk%3A43210 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2009/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2009/orjk%3A43210 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F07%2F0353/2010/ico%3A67985904

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software