About: Analysis of Radish mosaic virus (Comovirus) genome

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Analysis of Radish mosaic virus (Comovirus) genome Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA522/07/0053
Description	Unique collection of about 20 world isolates of radish mosaic virus (RaMV) has been created and is maintained at the IPMB. RaMV is the last worldwide-distributed comovirus of high economic importance (infecting brassicas), for which no sequence data are available. We propose to identify its complete genome sequence, analyse capsid proteins sequence variability of world isolates, sequence and compare distant sites of the genome of several isolates to confirm hypothesis of natural recombination in comoviruses. We will characterize a new brassica-infecting comovirus, recently isolated form turnip in USA and compare it with RaMV. The benefits of the project are in the first molecular improvement of detailed knowledge of the virus genome. The capsidprotein sequence variability analysis brings unique data that will be compared and complemented with the serological and RaMV host range analysis data from our previous studies. No similar analysis of serotypes or isolates has been conducted on viruses (en) Na našem pracovišti byla v minulosti vytvořena unikátní sbírka více než 20 světových izolátů Viru mozaiky ředkvičky (RaMV). Virus je ekonomicky významným patogenem brukvovitých plodin. Je jedním z posledních celosvětově rozšířených comovirů, u kterého není známa sekvence genomu. Navrhujeme zjistit kompletní sekvenci genomu tohoto viru. Chceme analyzovat variability obou kapsidových proteinů a provést korelaci sekvenčních dat s výsledky našich předchozích sérologických analýz a údaji o okruhu hostitelských rostlin viru. Sekvenční analýzou několika míst genomu u řady izolátů RaMV chceme prokázat hypotézu o rekombinantním původu některých izolátů. Zanalyzujeme a identifikujeme nový comovirus z vodnice izolovaný v USA, a porovnáme jej s RaMV. Přínosem projektu bude významný pokrok v poznání genomu zkoumaného viru, fylogenetických vztahů v rodu a na RaMV jako modelovém viru popíšeme evolučně významné oblasti genomu comovirů. Podobná zevrubná analýza dosud nebyla provedena u žádného jiného
Title	Analysis of Radish mosaic virus (Comovirus) genome (en) Analýza genomu viru mozaiky ředkvičky (Comovirus)
skos:notation	GA522/07/0053
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA522%2F07%2F0053/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA522%2F07%2F0053/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65679375
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	complete sequence; variability; evolution (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-22 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/522%2F07%2F0053
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	. (en) Projekt byl řešen v souladu s plánem a byly získány unikátní poznatky o struktuře genomu viru mozaiky ředkvičky (RaMV) a byl identifikován dosud neklasifikovaný Turnip ringspot virus (TuRSV). Studium variability genomů RaMV a TuRSV virů nepotvrdilo, že by (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	complete sequence variability
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Turnip ringspot virus recognized on Chinese cabbage in Russia Complete genome sequence of turnip ringspot virus Překlad názvu do češtiny/angličtiny: Emerging viruses in the genus Comovirus Complete genome sequence of broad bean true mosaic virus
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F07%2F0053/2007/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F07%2F0053/2008/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F07%2F0053/2009/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F07%2F0053/2010/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software