About: Identification and characterisation of regulatory cis-elements controlling pollen-specific expression of cytoskeletal and cell wall proteins

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Identification and characterisation of regulatory cis-elements controlling pollen-specific expression of cytoskeletal and cell wall proteins Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA522/06/0896
Description	Haploid male gametophyte, the male partner in sexual reproduction of flowering plants, plays a key role in plant fertility and crop production. Our ability to control and guide this process represents an effective tool for crop breeding and genetic optimalisation such as reduction of allergen content for which pollen is an important source. We have a very limited understanding of the regulatory mechanisms that have evolved to specify the gametophytic developmental program and ensure its flawless progress. To unravel such mechanisms, it is necessary to identify regulatory sequence motifs (cis-elements) in promoters of pollen-expressed genes and to isolate interacting proteins responsible for their transcriptional activation or repression. The presence of particular regulatory motifs was confirmed in a limited number of promoters of pollen genes. The goal of presented project is to extend our knowledge of regulatory processes controlling the male gametophyte development. In particular, the key (en) Haploidní samčí gametofyt, jeden z partnerů při pohlavním rozmnožování semenných rostlin, hraje klíčovou roli při zajišťování plodnosti rostlin a tím i produkce kulturních plodin. Schopnost kontrolovat a posléze ovlivňovat tento proces představuje efektivní šlechtitelský nástroj. Cílené vytváření pylově sterilních rostlin je stále důležitým nástrojem při produkci heterozního osiva. Navíc genetická optimalizace samčího gametofytu hospodářských plodin zaměřená na snižování obsahu alergenů je řešenímstoupající citlivosti současné populace vůči pylovým alergenům. Naše znalosti regulačních mechanismů, které vedou k zahájení gametofytického vývojového programu a zajišťují jeho bezchybný průběh na úrovni buněčné diferenciace, jsou velice omezené. Cílem předkládaného projektu je přispět k odhalení regulačních mechanismů tím, že budou popsány a experimentálně potvrzeny sekvenční motivy (cis-elementy) s regulační funkcí v promotorech vybraných pylových genů. K tomu má sloužit propojení bioinformatických
Title	Identification and characterisation of regulatory cis-elements controlling pollen-specific expression of cytoskeletal and cell wall proteins (en) Identifikace a charakterizace regulačních cis-elementů zodpovědných za pylově specifickou expresi cytoskeletálních a stěnových bílkovin
skos:notation	GA522/06/0896
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA522%2F06%2F0896/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA522%2F06%2F0896/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-10-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	68675475
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	male gametophyte; transcription regulation; genome-wide analysis; bioinformatics; cytoskeleton; cell wall (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	8 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	8 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2008-04-25 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/522%2F06%2F0896
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2008
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2009
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02006GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2008-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	ED - Fyziologie GE - Šlechtění rostlin
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Projekt si kladl za cíl otevřít otázku globální regulace gametofytického vývojového programu za pomoci bioinformatických nástrojů dostupných v současné %22postgenomové%22 éře. Konkrétně se jednalo o 1) nalezení regulačních cis-elementů zodpovědných za pylově (cs) The project aimed at opening the issue of global regulation gametophytic developmental program by exploiting currently available bioinformatics tools. Specific objectives were 1) to find cis-regulatory elements responsible for the male-specific gene expr (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	male gametophyte bioinformatics cytoskeleton genome-wide analysis transcription regulation
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	ONLINE TOOLS FOR PRESENTATION AND ANALYSIS OF PLANT MICROARRAY DATA AtbZIP34 is required for Arabidopsis pollen wall patterning and the control of several metabolic pathways in developing pollen Arabidopsis Gene Family Profiler (aGFP) - user-oriented transcriptomic database with easy-to-use graphic interface Generalization of DNA microarray dispersion properties: microarray equivalent of t-distribution Identification of microspore-active promoters that allow targeted manipulation of gene expression at early stages of microgametogenesis in Arabidopsis Male gametophyte development and function Pollen development, a genetic and transcriptomic view Male Gametophyte Development and Function
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F06%2F0896/2007/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F06%2F0896/2008/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F06%2F0896/2009/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA522%2F06%2F0896/2006/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software