About: Factors involved in regulation of DNA methylation in plants

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Factors involved in regulation of DNA methylation in plants Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA521/98/0045
Description	The aim of the proposed project is to investigate the control and biochemical pathways of the cellular mechanism leading to methylation of cytosine nucleotides in plant DNA. We will focus (i) on S-Adenosylmethionine (SAM) which is a universal donor of methyl groups in all living organisms and (ii) on S-Adenosylhomocysteine (SAH) which is an inhibitory product of transmethylation reactions. These metabolites may play a key role as their concentrations are under environmental and physiological control. In this way changes in SAM and-or SAH pools might regulate DNA methylation in plant cells and thereby change genotype programming and expression patterns. Biosynthetic pathways of SAM and SAH metabolites will be investigated using specific enzyme inhibitors. Emphasis will be put on the study of the environmental factors such a drought, high salinity and low temperatures with respect to alterations of intracellular levels of SAM and SAH metabolites and changes in methylation status of DNA. The pr (en) Navrhovaný projekt je zaměřen na biologické funkce metylace DNA u vyšších eukaryotických organismů. Metylační modifikace cytosinových zbytků u většiny eukaryotických genomů patří mezi nejdůležitější epigenetické mechanismy, podílející se významnou měrou na diferenciaci a vývoji organismu. Centrem zájmu bude objasnění mechanismů regulace rostlinných DNA metyltransferáz katalyzujících metylaci cytosinu v poloze 5 pyrimidinového cyklu. Pomocí metabolických inhibitorů budou zkoumány metabolické dráhy ovlivňující buněčné pooly kofaktorů. S-adenosylmethioninu (SAM) a S-adenosylhomocysteinu (SAH) a tím i hladinu metylovaného cytosinu v DNA. Budou zkoumány jak endogenní (fytohormony), tak i exogenní (abiotický stres) faktory ovlivňující rovnováhu SAM/SAHZměny v metylačním obraze DNA budou korelovány se změnami ve struktuře jaderného chromatinu a expresi jak ubikvitárních tak i tkáňově-specifických genů. Budou zkoumány epigenetické změny buněčného jádra při diferenciaci a v podmínkách abiotického stresu.
Title	Factors involved in regulation of DNA methylation in plants (en) Faktory regulující metylaci DNA u rostlin
skos:notation	GA521/98/0045
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F98%2F0045/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F98%2F0045/celkoveNaklady
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	598474
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	12 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	12 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2001
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Přínos projektu je vysoký. Pozoruhodné výsledky, týkající se aktivity rostlinné S-adenosylhomocystein hydrolasy v přítomnosti acyklických analogů adenosinu. Podařilo se blokovat aktivitu buněčné DNA-metyltransferázy in vivo. Byla zjištěna dobrá korelace (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	The origin and evolution of geminivirus-related DNA sequences in Nicotiana Evaluation of the impact of S-adenosylhomocysteine metabolic pools on cytosine methylation of the tobacco genome. Mapping of 5-methylcytosine residues in Nicotiana tabacum 5S rRNA genes by genomic sequencing. Cross-talk between posttranscriptionally silenced neomycin phosphotransferase II transgenes. Comparative analysis of DNA methylation in tobacco heterochromatic sequences. Automatizovaná metoda stanovení viability buněk v suspenzní kultuře. Genotoxic effect of cadmium is associated with apoptotic changes in tobacco cells. Gene conversion of ribosomal DNA in Nicotiana tabacum is associated with undermethylated, decondensed and probably active gene units. Molecular cytogenetic analyses and phylogenetic studies in the Nicotiana tabacum section Tomentosae. Estimation of Viable Cell Count after Fluorescein Diacetate Staining Phosphoimager Analysis. Drug-induced hypomethylation of a posttranscriptionally silenced transgene locus of tobacco leads to partial release of silencing. Molecular and structural evolution of Citrus satellite DNA.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F98%2F0045/1998/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F98%2F0045/1998/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F98%2F0045/1999/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F98%2F0045/1999/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F98%2F0045/2000/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F98%2F0045/2000/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F98%2F0045/2001/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software