This project focuses on the evolution of the genome size in the family Zingiberaceae. Holo- and homoploid genome sizes will be measured in ca 200-250 species of the family covering all subfamilies and tribes recognized in recent studies with particular focus on the the various phylogenetic lineages in genera where polyphyly has been detected. Data gained on both, holo- and homoploid, genome sizes will be superimposed on a robust phylogenetic tree and correlations will be sought. (en)
Projekt je zaměřen na studium evoluce velikosti genomu v čeledi Zingiberaceae. Bude měřena holo- a monoploidní velikost genomu u ca 200-250 zástupců čeledi pokrývajících všechny čtyři podčeledi, respektive všech šest tribů, stejně tak i různé phylogenetické linie u rodu, kde byla detekováno polyfylie. Získané velikosti genomu budou mapovány na robustní fylogenetický strom a bude vyhledána korelace se známou fylogenezí čeledi.
Byla zjištěna prvotní data o velikosti genomu u 300 druhů čeledi Zingiberaceae a příbuzných čeledí. Ze sekvencí nukleárních a chloroplastových genů zjištěny fylogenetické vztahy. Bylo zjištěno, že v průběhu evoluce se velikost genomu zmenšuje. U Lowiaceae jsou genomy významně větší, u čeledi Marantaceae významně větší. Řešení vynikající. (cs)
Genome size of 300 species of Zingiberaceae and related families was measured firstly. Phylogeny based on chloroplast and nuclear sequences were constructed. There is a general tendency decrease the genome size during evolution. Related Lowiaceae and Marantaceae possess larger and smaller genomes, respectively. (en)