About: Hypoxia response in the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Hypoxia response in the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA310/06/0645
Description	Recently, a unique hypoxia-response has been described in the obligate aerobic pathogenic yeast Cryptococcus neoformans. When oxygen concentration drops in culture under conditions of limited aeration, it delays the onset of budding to G2 which is gradually prolonged, resulting eventually in unbudded G2-arrest. Random mutants will be prepared and screened for deviations from the hypoxia-induced phenotype of the parental strain. Selected mutants will be characterised in detail and genomic library of the parental strain will be used for transformation of suitable strains. Transformants will be screened for reversion of the mutant phenotype and promising candidates will be characterised in detail. Complementing inserts will be sequenced, ORFs will be identified and homologous sequences will be identified in databases. To verify and characterise the function of the identified ORFs in detail, deletion mutants will be prepared. The main expected outcome is identification of one or more key components (en) Nedávno byla u obligátně aerobní patogenní kvasinky Cryptococcus neoformans popsána unikátní odpověď na hypoxii. Když při omezeném provzdušňování klesne v kultuře koncentrace kyslíku, kvasinka posouvá začátek pučení do G2-fáze, která se postupně prodlužuje, což nakonec vede k zastavení cyklu v podobě velkých nepučících G2-buněk. Budeme připravovat náhodné mutanty a vyhledávat u nich odchylky od hypoxického fenotypu výchozího kmene. Vybrané mutanty budeme podrobně charakterizovat a vhodné mutantytransformovat genomovou knihovnou z výchozího kmene. U transformantů budeme vyhledávat reverzi mutantního fenotypu a slibné kandidáty budeme podrobněji charakterizovat. Budeme sekvencovat komplementující inzerty, identifikovat otevřené čtecí rámce (geny)a homologní sekvence v databázích. Budeme připravovat deleční mutanty pro ověření a charakterizaci funkce těchto genů. Hlavním očekávaným výsledkem je identifikace některých klíčových komponent kryptokokové reakce na hypoxii. Lepší pochopení mechanismu
Title	Hypoxia response in the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans (en) Odpověď na hypoxii u patogenní kvasinky Cryptococcus neoformans
skos:notation	GA310/06/0645
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA310%2F06%2F0645/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA310%2F06%2F0645/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-10-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	68674714
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	hypoxia; cell cycle; pathogenic yeast; Cryptococcus neoformans (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2008-04-25 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/310%2F06%2F0645
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2008
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2009
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02006GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2008-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Projekt identifikoval jednu novou komponentu reakce na hypoxii u C. neoformans, konkrétně gen CNAG_00156.2 kódující transkripční faktor, který je na základě analýzy in silico a fenotypové analýzy ve stresových podmínkách velmi pravděpodobně homologem CRZ (cs) One new component of C. neoformans hypoxia response has been identified, namely the gene CNAG_00156.2 coding for a transcription factor. Based on results of sequence analysis in silico and phenotypic analysis we conclude this factor to represent cryptoco (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	hypoxia cell cycle pathogenic yeast
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Growth Strategy of the Pathogenic Yeast Cryptococcus neoformans Submerged Culture under Different Cultivation Formats Peculiar Clusters of Daughter Cells Observed in Cryptococcus neoformans Grown in Sealed Microtiter Plates Hypoxia sensing in Cryptococcus neoformans: Biofilm-like adaptation for dormancy? The CRZ1/SP1-like gene links survival under limited aeration, cell integrity and biofilm formation in the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F06%2F0645/2007/orjk%3A15110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F06%2F0645/2008/orjk%3A15110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F06%2F0645/2009/orjk%3A15110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F06%2F0645/2006/orjk%3A15110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software