About: Determination of the histone H5 globular domain position within the native nucleosome using cryo-electron microscopy and single particle reconstruction.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Determination of the histone H5 globular domain position within the native nucleosome using cryo-electron microscopy and single particle reconstruction. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA304/05/2168
Description	The first level of the chromatin compaction, the formation of the 30 nm chromatin fibre, still remains partly unresolved, especially the process of its transition from a relaxed zig-zag at low ionic conditions into q compact fibre at physiological concentrations. It is evident that the presence of the linker histone is necessary for organised fibre folding. However, its position within the nucleosome still represent not fully resolved problem, its exact position relative to the histone octamere and entering/exiting DNA is determinant for the topological properties of both the individual nucleosome and the chromatin fibre. This project aims to determine the position of the globular domain of linker histone H5 on native nucleosome using cryo-electron microscopy and single particle reconstruction. The expected results shall resolve a long lasting ambiguity in the determination of the linker histone position, persistent in the literatuoe over the last decade. Revealing the structural (en) První stupeň organizace chromatinu, 30nm chromatinové vlákno, stále zůstává částečně nevyřešen, zejména jeho přechod z relaxované zig-zag struktury existující při nízké koncentraci iontů do kompaktního vlákna za fyziologických podmínek. Je zřejmé, že přítomnost spojovacího histonu je nezbytná pro organizovaný přechod do kompaktního stavu. Nicméně, přesná poloha tohoto histonu stále představuje nevyřešený problém. Jeho přesná poloha vzhledem k histonovému oktaméru a vstupující a vystupující DNA je určující pro topologické vlastnosti jak jednotlivého nukleosomu, tak celého chromatinového vlákna. Tento projekt zamýšlí určit pozici globulární domény histonu H5 v nativním nukleosomu pomocí kryo-elektronové mikroskopie a rekonstrukce objektu. Očekávanývýsledek by měl vyřešit přetrvávající nejednoznačnosti v určení pozice H5, které existují v literatuře již téměř deset let. Určení strukturálního uspořádaní vstupní-výstupní oblasti nukleosomu bude podstatné pro pochopení organizace chromatinového vlákna
Title	Determination of the histone H5 globular domain position within the native nucleosome using cryo-electron microscopy and single particle reconstruction. (en) Určení pozice globulární domény histonu H5 v nativním nucleosomu pomocí kryo-elektronové mikroskopie a rekonstrukce isolované částice.
skos:notation	GA304/05/2168
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA304%2F05%2F2168/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA304%2F05%2F2168/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-12-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	71263742
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	1. lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2007-05-02 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/304%2F05%2F2168
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2007
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2008
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02005GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2007-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2005-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Původně stanoveného cíle, tedy stanovení polohy globulární domény spojovacího histonu H5 v nukleozomu, se dosáhnout nepodařilo a to zejména z důvodů uvedených v části 2 části ZC. Tyto důvody vedly k modifikaci původního plánu a k hledání alternativních m (cs) The original aim of the project i.e. the determination of the position of the linker histone H5 globular domain within the nucleosome has not been reached, particularly due to reasons stated in the paragraph 2. of the part ZC. Those reasons induced the m (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Dissection of the unusual structural and functional properties of the variant H2A. Bbd nucleosome New Insights into Nucleolar Architecture and Activity Remosomes: RSC generated non-mobilized particles with approximately 180 bp DNA loosely associated with the histone octamer Spontaneous Formation of Densely Stacked Multilamellar Vesicles in Dioctadecyldimethylammonium Bromide/Oleosiloxane Mixtures Silicone-stabilized liposomes The docking domain of histone H2A is required for H1 binding and RSC-mediated nucleosome remodeling Hybrid Silica-Silicone Nanocapsules Obtained in Catanionic Vesicles. Cryo-TEM Studies The Dynamics of Individual Nucleosomes Controls the Chromatin Condensation Pathway: Direct Atomic Force Microscopy Visualization of Variant Chromatin Dnešní mikroskopie v biomedicíně: Tak trochu jinak
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA304%2F05%2F2168/2007/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA304%2F05%2F2168/2008/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA304%2F05%2F2168/2005/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA304%2F05%2F2168/2006/orjk%3A11110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software