About: Structural and functional determinants on channels TRPC3, TRPV1, TRPV2 and TRPA1     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • The main aims of this proposal are to determine of the secondary structures of N- and C - intracellular termini of channels TRPC3, TRPV1, TRPV2 and TRPA1. In addition to localize of binding sites for calmodulin on both termini of TRPV2 and TRPA1, and on C- termini of TRPV1, to describe the binding sites for adaptor proteins like eferin or junctate on TRPV1, TRPV2 and TRPA1, the binding sites for ATP (in case of TRPV1 Walker motif A in C -termini and Walker motif in N-termini ) and precise localization of caveolin binding site on  N - termini of TRPC3. The series of different lengths of fusion proteins of both termini of four channels will be performed to get sufficient amounts of soluble proteins. Another goal will be to localize the selectivity filter in the P loop between TM5 and TM6 in TRPC3 and TRPA1 respectively, and to describe the role of the of aminoacids residues in the lower part of alpha- helix of TM6 in gating process of  TRPV2, TRPC3 and TRPA1 channels. (en)
  • Superrodina  transient receptor potential (TRP) kanálů se skládá ze tří hlavních rodin, TRPC, TRPV a TRPM. TRPC tvoří rodinu sedmi kanálů propustných pro Ca2+. Všechny  TRP kanály  mají podobnou strukturu šesti transmembránových domén, mezi pátou a šestou transmembránovou doménou je oblast poru, která je lokalizována v membráně a umožňuje propustnost iontů a v intracelulárním prostoru umístěné jak N- či C-konce kanálu. Budou zjištěny sekundární struktury N-C- intracelulárních kosů u kanálů TRPC3, TRPV1, TRPV2 a TRPA1. Dále budou určena vazebná místa pro calmodulin na obou koncích TRPV2 a TRPA1 a na C- konci TRPV1. Měli by být zjištěny vazebná místa pro adaptorové proteiny jako je eferin nebo junctate na TRPV1, TRPV2 a TRPA1.  Bude určena struktura vazebného místa pro ATP, tzv. Walkerova motivu A na C konci v Walker motivu B na  N konci TRPV1. Dále bude zjištěna funkce selektivního filtru v póru kanálu TRPC3 a TRPV1 a popsána úloha jednotlivých aminokyselinových zbytků v C konci alfa
Title
  • Structural and functional determinants on channels TRPC3, TRPV1, TRPV2 and TRPA1 (en)
  • Strukturní a funkční determinanty na kanálech TRPC3, TRPV1, TRPV2 a TRPA1
skos:notation
  • GA303/07/0915
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • TRP channels; structure; transmembrane domain; N- and C-termini; molecular model (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • . (en)
  • Projekt byl řešen velmi úspěšně, bylo uveřejněno deset kvalitních publikací. Byly dosaženy výsledky významně rozšiřující výsledky týkající se vztahu mezi strukturou a funkcí příslušných receptorů. Panel se vsak domnívá, že počet dedikací u některých publi (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
  • N- and C-termini
  • structure
  • transmembrane domain
  • TRP channels
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software