New methods will be proposed based on electrochemical principles, mass spectrometry and separation techniques. Special attention will be paid to (a) tracing of early changes preceding aggregation of amyloidogenic proteins involved in Parkinson's and Alzheimer diseases and (b) to wild type and mutated tumor suppressors and/or oncogenes. Electrochemical methods will be proposed capable to recognize changes in the mutated proteins caused to single amino acid exchange. The ability of thiolated oligonucleotides to form self-assembled monolayers and to produce specific electrochemical signals will be utilized in the development of sensors for DNA-protein interactions and for determination of DNA point mutations. In the last stage of this projectattempts will be made to apply some of the proposed methods to samples from patients. (en)
Je navrhováno vytvořit nové metody detekce konformačních změn proteinů využívajících principů elektrochemických v kombinaci se separačními metodami a hmotovou spektrometrií. Zvláštní pozornost bude věnována (a) sledování časných změn předcházejícím agregaci amyloidogenních bílkovin, které jsou důležité v Parkinsonově a Alzheimerově chorobě a (b) standardním a mutovaných nádorovým supresorům anebo onkogenům. Budou navrženy metody schopné rozpoznat změny v mutovaných bílkovinách způsobené záměnou jediné aminokyseliny. Schopnost sírou modifikovaných oligonukleotidů tvořit samoorganizované monovrstvy a poskytovat specifické elektrochemické signály bude využita při vývoji senzorů pro detekci interakcí DNA s proteiny a pro stanovení bodových mutací. V poslední fázi tohoto projektu bude učiněn pokus o aplikaci některé z navržených metod k analýze vzorků získaných od pacientů.
Projekt byl řešen dle jeho anotace, ke zprávě je přiloženo 19 publikací se správnou dedikací. Rozmezí IF se pohybuje mezi hodnotou 3-7, kumulativní IF je větší než 80. Vzhledem k publikační aktivitě hodnotí OK3 projekt jako vynikající (vysoce excelentní). (cs)