About: Analysis of syntenic group of genes conserved between mammals and invertebrates by molecular genetics methods

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Analysis of syntenic group of genes conserved between mammals and invertebrates by molecular genetics methods Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA204/98/P131
Description	A syntenic group of genes conserved in human, mouse, Drosophila, and C. elegans genomes was discovered during positional cloning of the Hybrid sterility 1 gene on mouse chromosome 17 (Trachtulec et al., Genomics 44: 1-7(1997)). This is the first highly conserved linkage of homologous genes without any apparent common function on one chromosome in each species. The aim of the proposed project is to analyse the members of this group, localize new members, and try to find reasons for its conservation. Weplan to reach this goal in two steps. First, we will map new genes to mouse chromosome 17 by the help of human genes from the syntenic region, by transcript isolation from the Hst1 region and by searching in databases. In the second step, which is dependent on the results of the first step, we plan to analyze orientation of closely linked syntenic genes, their chromatine loops (domains) and expression pattern, and to determine their isochores. The realization of this project will lead to a better (en) V průběhu pozičního klonování genu Hybrid sterility I (Hst) na myším chromozomu 17 jsme zjistili, že existuje syntenní skupina genů konzervovaná v genomu člověka, myši a bezobratlých. Poprvé tak byla nalezena skupina syntenních genů, bez zjevné společné funkce, která se dá sledovat až do genomu Caenorhabditis elegans a Drosophily melanogaster. Cílem navrhovaného projektu je analyzovat geny námi objevené syntenní skupiny, mapovat nové geny do této skupiny a pokusit se nalézt důvody pro její konzervaci. Projekt hodláme realizovat ve dvou krocích. V prvním kroku chceme lokalizovat nové geny na myší chromozom 17 pomocí lidských genů ze syntenní oblasti, transkripčním mapováním oblasti kolem Hst 1 genu a hledáním v databázích. Ve druhém kroku, který závisína výsledcích prvního, hodláme určit orientaci genů a jejich isochory a mapovat chromatinové smyčky u sousedících syntenních genů. Použijeme metod %22exon trapping%22 nebo cDNA selekce nových genů Hst 1 oblasti. Realizace projektu povede k charakterizaci sku
Title	Analysis of syntenic group of genes conserved between mammals and invertebrates by molecular genetics methods (en) Molekulárně genetická analýza syntenní skupiny genů konzervované mezi savci a bezobratlými
skos:notation	GA204/98/P131
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F98%2FP131/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F98%2FP131/celkoveNaklady
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	598228
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2001
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Postup a metodika prací je v souladu se stanoveným záměrem. Grant přinesl významná zjištění pro genomiku, spočívající ve srovnávání vlastností genomů bezobratlých a myši. Byly předloženy přesvědčivé důkazy syntemie mezi evolučně velmi vzdálenými organizm (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Transcription and RNA processing of mammalian genes in Saccharomyces cerevisiae. Mouse Chromosome 17. Syntenies of unrelated genes conserved in mammals and nonvertebrates.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2FP131/1998/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2FP131/1999/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2FP131/2000/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2FP131/2001/ico%3A68378050

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software