About: SNW Proteins in signal transduction

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: SNW Proteins in signal transduction Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA204/98/0406
Description	The SNW proteins are being found in diverse types of eukaryotic cells (including yeast, plant, Dictyostelium, worm, insect and man) and contain highly conserved regions implicated in protein-protein interactions (SH2-like, proline rich, amfipathic helix). SNW homologs are suggested to bind to transcription factors, their function, however, remains to be determined. Our hypothesis is that the SNW proteins are coactivators of nuclear transcription factors, integrating signal transduction pathways. Waim to test this hypothesis in Dictyostelium and characterize the partners of SNW both in vivo and in vitro. We plan to: (i) express SnwA and it's domains in Dictyostelium under the control of heterologous promoters, (ii) complement the function of SnwA using the homologs FUN20 and Spac8A4, and (iii) manipulate with SnwA in developmentally defective strains. In the second part of the project, we plan to search for the partners of SnwA using two hybrid-screen with multiple baits. We will characterize the (en) Proteiny SNW byly nalezeny v eukaryotních buňkách různých typů (včetně kvasinky, Arabidopsis, Diktyostelium, Caenorhabditis, Drosophila a člověka). Obsahují vysoce konzervované oblasti, implikované v interakcích mezi proteiny (domény SH2-typu, prolinové úseky, amfipatické helixy). Je možné, že se SNW-homologní proteiny váží na transkripční faktory, funkce SNW však prokázána nebyla. Naše hypotéza je, že proteiny SNW jsou koaktivátory transkripčních faktorů a že integrují dráhy přenosu signálu. Chceme testovat tuto hypotézu v Dictyostelium a charakterizovat partnery SnwA in vitro i in vivo. Plánujeme: (i) exprimovat SnwA a jednotlivé domény v Dictyostelium pod kontrolou heterologních promotorů, (ii) komplementovat funkci SnwA s použitím homologů FUN20a Spac8A4, a (iii) manipulovat s SnwA ve vývojových mutantech. Ve druhé části projektu chceme hledat partnery SnwA s použitím dvouhybridního systému s více návnadami. Budeme charakterizovat partnery SnwA in vitro a v liniích Dictyostelium.
Title	SNW Proteins in signal transduction (en) Proteiny SNW v přenosu signálu
skos:notation	GA204/98/0406
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F98%2F0406/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F98%2F0406/celkoveNaklady
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	596494
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2001
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	V průběhu řešení projektu kolektiv řešitele dospěl k řadě vysoce kvalitních výsledků. Především se jedná o prioritní poznatky, týkající se nového typu koaktivátorů transkripce, SNW proteinech a jejich interakci s cyklofiliny CypE/spCyp2 a s komponentou s (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	The fission yeast ortholog of the coregulator SKIP interacts with the small subunit of U2AF Signaling downstream of transcription factors - transcription coactivators and corepressors Characterization of an evolutionarily conserved interaction between Snw1, the fission yeast homolog of the steroid receptor coactivator SKIP, and the novel cyclophilin Cyp2. Cyclophilins of a novel subfamily interact with SNW/SKIP coregulator in Dictyostelium discoideum and Schizosaccharomyces pombe
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2F0406/1998/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2F0406/1999/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2F0406/2000/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F98%2F0406/2001/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 24 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software