About: Interactions of tumor suppressor proteins with DNA. Roles of DNA conformation and protein modifications

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Interactions of tumor suppressor proteins with DNA. Roles of DNA conformation and protein modifications Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA204/02/0734
Description	The ability of tumor suppressor protein p53 to bind to specific DNA sequences and to certain types of DNA conformational motifs are crucial for its function in regulating transcription as well as in its transcription-independent roles in DNA repair and recombination. Loss of the p53 DNA binding functions frequently results in cancer development. In this project, we propose to study interactions of p53 and other p53-related checkpoint proteins with DNA structures specific for supercoiled DNA (to which wild type p53 binds with a strong preference: Palecek et al., Oncogene 1997, 15, 2201-2209) such as open local structures or bents. Binding selectivity of the protein to these structures will be studied using wild type p53 as well as deletion mutants (involving the p53 DNA-binding core and C-terminal domains, and the oligomerization domain) and fusion constructs, and p53 homologues such as protein p73. We propose to study the roles of the individual protein domains and the effects of (en) Schopnost proteinu p53 vázat se na specifické sekvence DNA a na určité konformační motivy v DNA je zásadní pro funkci tohoto proteinu v regulaci transkripce i jeho transkripčně-nezávislých úloh při opravách DNA, rekombinaci atd. Ztráta DNA-vazebných funkci p53 často vede ke vzniku maligních nádorů. V tomto projektu navrhujeme zkoumat interakce p53 a dalších proteinu kontrolních míst (checkpoint) se strukturami DNA specifickými pro nadšroubovicovou DNA (na kterou se p53 váže s vysokou preferencí: Paleček et al., Oncogene 1997, 15, 2201-2209), jako jsou otevřené lokální struktury, ohyby apod. Vazebná selektivita proteinu k těmto strukturám bude studována se standardním typem p53 a s delečními mutanty (zasahujícími centrální a C-koncovou DNA vazebnou doménu p53, a jeho oligomerizační doménu) a fúzními konstrukty a homology p53 (např. protein p73). Navrhujeme studovat úlohy jednotlivých domén p53 a vliv jeho posttranslačních modifikací a vazby dalších bílkovin na N- a C- konci p53
Title	Interactions of tumor suppressor proteins with DNA. Roles of DNA conformation and protein modifications (en) Interakce nádorově supresorových proteinů s DNA. Úlohy konformace DNA a modifikací proteinu
skos:notation	GA204/02/0734
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F02%2F0734/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F02%2F0734/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-06-02 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1564756
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	7 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	7 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2004
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2005
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2005
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02002GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie FD - Onkologie a hematologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Results of this project contributed to the knowledge about interactions of protein p53 with DNA, in particular with respect to the DNA conformation, its topological state and damage. The p53 C-terminal domain (CTD) plays a primary role in the protein sup (en) Výsledky řešení projektu přispěly k poznání interakcí proteinu p53 s DNA, především s ohledem na konformaci a topologický stav DNA a její poškození. Při selektivní interakci p53 s nadšroubovicovou DNA (SCS vazba) mimo specifické vazebná místa (p53CON) hr (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Differential recognition by the tumor suppressor protein p53 of DNA modified by the novel antitumor trinuclear platinum drug BBR3464 and cisplatin Investigations of the supercoil-selective DNA binding of wild type p53 suggest a novel mechanism for controlling p53 function Searching for target sequences by p53 protein is influenced by DNA length Recognition of cisplatin-damaged DNA by p53 protein: Critical role of the p53 C-terminal domain Sledování interakcí DNA s proteiny pomocí elektroforézy v agarosových gelech s následným western přenosem s imunodetekcí. Recognition of DNA modified by antitumor cisplatin by 'latent' and 'active' protein p53. Studies of DNA-protein interactions by means of a piezoelectric biosensor.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F02%2F0734/2002/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F02%2F0734/2003/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F02%2F0734/2004/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F02%2F0734/2005/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 91 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software