About: Cold-shock proteins of streptomycetes and their role in regulation of gene expression

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Cold-shock proteins of streptomycetes and their role in regulation of gene expression Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/98/0422
Description	Aim of this proposal is to clarify the question whether induction of cold shock proteins by downshift in temperature or by production of antibiotic (tetracycline) is a part the mechanisms regulating efficient translation of mRNA's of tetracycline biosynthetic genes, proteins involved in mechanism of resistance or developmental specific genes of streptomycetes. Expression of cold shock proteins and their association with ribosomes will be examined. Experiments will be performed to test whether phosphorylation/dephosphorylation of ribosomal proteins is involved in modulation association of proteins, mRNA and tRNA to ribosome. Helix-destabilizing activity of the induced proteins will be examined using synthetic dsRNA in gel retardation experiments and in RNAase stimulated band shift assay. Protein(s) with helix-destabilizing activity will be identified using microsequencing. On the basis of obtained sequences oligonucleotide probes will be prepared and used for isolation of the corresp (en) Navrhovaný projekt má objasnit otázku, zda indukce proteinů chladového šoku, vyvolaná poklesem teploty, nebo produkcí antibiotik (tetracyklinu) je součástí mechanismů, které reagují účinnou translaci mRNA tetracyklin biosyntetických genů, proteinů zahrnutých v mechanismu rezistence nebo mRNA vývojově specifických genů streptomycet. Bude studována exprese proteinů chladového šoku a jejich asociace s ribosomy. Budou analyzovány posttranslační modifikace ribosomálních bílkovin (fosforylace/defosforylace), které mohou modulovat asociace proteinů, mRNA a tRNA s ribosomy. Indukované proteiny s helix destabilizující aktivitou budou izolovány a charakterizovány pomocí syntetických dsRNA substrátů, gelovou retardací a změnou pohyblivostí účinkem RNAas(band shift assay). Protein(y) s helix-destabilizující aktivitou bude identifikován pomocí mikrosekvenování. Podle peptidové sekvence budou připraveny oligonukleotidové sondy, izolován odpovídající gen a stanovena jeho nukleotid
Title	Cold-shock proteins of streptomycetes and their role in regulation of gene expression (en) Bílkoviny chladového šoku streptomycet a jejich úloha v regulaci genové exprese
skos:notation	GA203/98/0422
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F98%2F0422/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F98%2F0422/celkoveNaklady
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	596594
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	7 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	7 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2001
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Jedná se o kvalitní projekt, jehož cíle byly splněny. Závěrečná karta shrnuje adekvátním způsobem dosažené výsledky. Poznatky o regulaci stresové odpovědi mohou mít technologický význam. Na projektu pracoval (jak vyplývá nepřímo ze zprávy) jeden student. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Point pattern matching in the analysis of two-dimensional gel electropherograms. Neural network model of gene expression. Expression of the Csp protein family upon cold shock and production of tetracycline in Streptomyces aureofaciens. Palladium(II) Complexes of 2-Dimethylamino-2'-diphenylphosphino-1,1'-binaphtyl (MAP) with Unique P,C-Coordination and Their Catalytic Activity in Allylic Substitution, Harwig-Buchwald Amination, and Suzuki Coupling Isolation and characterization of dcw cluster from Streptomyces collinus producing kirromycin. Characterization of the rplB gene from Streptomyces collinus and its protein product by mass spectrometry. Changes in ribosome function induced by protein kinase associated with ribosomes of Streptomyces collinus producing kirromycin.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F98%2F0422/1998/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F98%2F0422/1999/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F98%2F0422/2000/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F98%2F0422/2001/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software