About: Study of the molecular mechanisms of biodegradation reactions - construction of QSBR models and protein engineering of haloalkane dehalogenases

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Study of the molecular mechanisms of biodegradation reactions - construction of QSBR models and protein engineering of haloalkane dehalogenases Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/97/P149
Description	The project is focused on biodegradation of the organic compounds by microorganisms. Fundamental mechanisms of the biodegradation reaction and the molecular level will be studied. The methods of Quantitative Structure-Biodegradability Relationships (QSBR) a in vitro modifications of the proteins will be employed. These methods will be used to investigate the biological degradation of halogenated aliphatic compounds which belong to common groundwater and soil contaminants. Mathematical models servinfor the predictions of biodegradability of halogenated compounds will be constructed within the project. These models can find their use in the Environmental Risk Assessment. Modification in the enzymes haloalkane dehalogenases will be proposed using thecomputer modelling. These modifications should lead towards better activity and/or broader specificity of the dehalogenating enzymes. (en) Předkládaný projekt bude řešit problematiku biodegradace organických sloučenin mikroorganismy. Studovány budou základní mechanismy biodegradačních reakcí na molekulární úrovni. Praktické výstupy tohoto studia budou orientovány do oblasti předpovědi biodegradability sloučenin z jejich struktury (Quantitative Structure-Biodegradability Relationship, QSBR) a in-vitro modifikace biodegradačních enzymů. Konkrétně bude studována biodehalogenace halogenovaných alifatických uhlovodíků - sloučenin patřícíchmezi časté kontaminanty půd a podzemních vod. Výsledkem projektu budou matematické modely sloužící k předpovědím rychlosti degradace těchto sloučenin aerobními mikroorganismy, použitelné v environmentální analýze rizik. Dále budou s využitím molekulovéhomodelování navrženy modifikace v enzymech haloalkan dehalogenasách vedoucí ke zlepšeným katalytickým vlastnostem těchto enzymů a jejich vyšší účinnosti při odbourávání haloalifatických sloučenin.
Title	Study of the molecular mechanisms of biodegradation reactions - construction of QSBR models and protein engineering of haloalkane dehalogenases (en) Studium molekulárních mechanismů biodegradačních reakcí - konstrukce QSBR modelů a proteinové inženýrství dehalogenas
skos:notation	GA203/97/P149
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F97%2FP149/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F97%2FP149/celkoveNaklady
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	596574
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	15 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	15 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2001
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	DK - Kontaminace a dekontaminace půdy včetně pesticidů EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Postup a metodika prací je v souladu se stanoveným záměrem. Vysokou erudici řešitele a mimořádnou kvalitu zpracování projektu dokumentuje celkově 10 publikačních výstupů v renomovaných časopisech. Finanční prostředky byly čerpány v souladu se schváleným (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Computational site-directed mutagenesis of haloalkane dehalogenase in position 172 Computer modelling of microbial hydrolytic dehalogenation Mechanism-based Quantitative Structure-Biodegradability Relationships for hydrolytic dehalogenation of chloro- and bromoalkenes Construction and characterization of histidine-tagged haloalkane dehalogenase (LinB) of a new substrate class from a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium, Sphingomonas paucimobilis UT26 Tetrachloroethene-dehalogenating bacteria Rapid detection of haloalkane dehalogenase activity by capillary zone electrophoresis Reaction mechanism and stereochemistry of gamma-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA TRITON: graphic software for rational engineering of enzymes TRITON: in silico construction of protein mutants and prediction of their activities Analysis of the reaction mechanism and substrate specificity of haloalkane dehalogenases by sequential and structural comparisons Identification of the catalytic triad in the haloalkane dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26 Dehalogenation of haloalkanes by Mycobacterium tuberculosis H37Rv and other mycobacteria Effect of the carbon source on assessment of degrading bacteria with the spread-plating technique during in situ bioremediation Determination of haloalkane dehalogenase enzymatic activity by capillary zone electrophoresis Determination of haloalkane dehalogenase enzymatic activity by capillary zone electrophoresis
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2FP149/1998/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2FP149/1999/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2FP149/2000/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2FP149/2001/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software