We propose to investigate the effect of substitution at the purine ring system upon the response of individual DNA polymerases to base-modi-fied diphosphates of acyclic nuc-leotide analogues. The ulti-mate goal of our project is to gain better un-derstanding of the nature of intera-ction of these enzymes with their su-bst-rates or inhibitors and to characterize interactions that are influenced by the topology of the active site. We hope to identify compounds (inhibitors) with explicit and selective interaction of individual polymerases and to verify general character of such properties. We aim to find compounds useful in moni-tor-ing such enzy-mes e.g. suitable tools to distinguish a role of replicative DNA polymerases in the synthesis of eucaryotic genome. Furthermore, we intend to correlate the in vitro ef-fects on isolated enzymes with the biological acti-vity of the compounds on the cellular models in vitro, or with other effects on cellular level that may be directly connected with the action on (en)
Projekt se zabývá vlivem strukturních obměn purinového skeletu difosfátů acyklických analog nukleotidů na jejich interakci s jednotlivými buněčnými DNA-polymerasami (z různých zdrojů). Cílem je získat nové informace o aktivních místech těchto enzymů prostřednictvím charakteru interakcí s jejich substráty a inhibitory. Předpokládáme, že nalezneme struktury (inhibitory) s vysoce selektivním účinkem, které mohou sloužit jako 'nástroje' k rozlišení úlohy replikativních polymeras při synthese eukaryotního genomu. Dosažené výsledky in vitro (na isolovaných enzymech) budou korelovány s účinky navrhovaných struktur na buněčné úrovni (studiem genotoxicity a mitochondriální toxicity). Uvedená srovnání nám umožní predikci struktur acyklických nukleotidů vedoucíchke 'gradaci' biologického účinku in vivo.
1. Řešení přináší některé zajímavé informace o procesu replikace a o DNA polymerasách. I testování protirakovinného působení studovaných látek přináší slibné výsledky. 2. Charakteristika výsledků v závěrečné kartě je zbytečně stručná. 3. Cíle byly splněn (cs)