About: Phosphoinositide compartments in the cell nucleus: structure and function

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Phosphoinositide compartments in the cell nucleus: structure and function Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA15-08738S
Description	DNA transcription is critically dependent on the spatial organization of the nucleus. Although a lot is known about the protein-DNA interactions involved in the maintenance of intranuclear order, the evidence for lipid contribution to this crucial process is missing. We have previously shown that a phosphoinositide - phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PI(4,5)P2) - promotes rDNA transcription and contributes to the structural maintenance of the nucleoli. In this project, we plan to map the localization and binding partners of various phosphoinositides (PIs) in the nucleus to identify their particular functions. Our preliminary data revealed that PI(4,5)P2 forms discrete foci in the nucleoplasm. We will analyze their molecular composition and their role in nuclear processes with the emphasis on transcription. We will uncover the cross-talk between various nuclear PIs and compare their distribution in various cell lines, tissues, and stages of cell cycle. It seems that PIs foci represent novel nuclear compartments that affect genome architecture and thus DNA transcription. (en) DNA transkripce je kriticky závislá na prostorovém uspořádání uvnitř jádra. Přestože hodně je známo o interakcích mezi proteiny a DNA, příspěvek lipidů k udržení organizace uvnitř jádra je zatím nejasný. V předchozí práci jsme ukázali, že fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát (PI(4,5)P2), člen skupiny fosfoinositidů (PIs), podporuje transkripci rDNA a navíc i přispívá k zachování struktury jadérka. V tomto projektu plánujeme detailně zmapovat lokalizaci různých PIs v nukleoplazmě a identifikujeme jejich vazebné partnery. Naše předběžná data ukazují, že PI(4,5)P2 se lokalizuje do oddělených ohnisek. Budeme analyzovat jejich molekulové složení a také jejich roli v jaderných procesech s důrazem na transkripci. Plánumeme také objasnit komunikaci mezi jednotlivými PIs a porovnat jejich distribuci v různých buněčných liniích, tkáních a různých stadiích buněčného cyklu. Z výsledků vyplývá, že PIs tvoří nové jaderné kompartmenty, které ovlivňují složení genomu a tím i transkripci DNA.
Title	Phosphoinositide compartments in the cell nucleus: structure and function (en) Fosfoinositidové kompartmenty v buněčném jádře: struktura a funkce
skos:notation	GA15-08738S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA15-08738S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA15-08738S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100808803
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	phosphoinositides; cell nucleus; transcription; PI(4,5)P2 (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/15-08738S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201500001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVZ
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2017-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2015-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	Z
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	cell nucleus transcription PI(4 phosphoinositides
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-08738S/2015/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-08738S/2016/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-08738S/2017/ico%3A68378050

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 22 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software