About: Nové metody pro předpověď a vizualizaci sekundárních struktur ribozomálních ribonukleových kyselin

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Nové metody pro předpověď a vizualizaci sekundárních struktur ribozomálních ribonukleových kyselin - integrované řešení Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA15-00885S
Description	Ribosomal ribonucleic acid (rRNA) is essential for the proteins synthesis, one of the most basic biological processes. To understand its mechanisms, the knowledge of the rRNA structure is required as it forms the structural core of the protein synthesizing unit, the ribosome. Experimental identification of rRNA structure is extremely technically difficult. Secondary structure, a simplified structural model, can be predicted, but prediction for rRNAs is hindered by extreme length of rRNA sequences. Thus, only few eukaryotic rRNA structures are available so far. We will employ information about evolutionary conserved segments of eukaryotic rRNA sequences for secondary structure prediction. An algorithmic workflow integrating the secondary structure prediction pipeline, visualization algorithm and database of the predicted structures will be developed. The predicted rRNA structures will be used for a novel bioinformatic identification of evolutionary conserved structural motifs in eukaryotic rRNAs that may bring new insights into the role of rRNA in the protein synthesis. (en) Ribozomální ribonukleová kyselina (rRNA) je esenciální pro proteinovou syntézu, jeden z nejzákladnějších biologických procesů. K porozumění jeho mechanismům je nezbytná znalost struktury rRNA, protože vytváří strukturní jádro syntetizující jednotky – ribozomu. Experimentální identifikace struktur rRNA je extrémně technicky obtížná. Sekundární struktura, zjednodušený strukturní model, může být předpovězená, ale předpověď pro rRNA je zkomplikovaná extrémní délkou sekvencí rRNA. Proto existuje jen několik struktur eukaryotických rRNA. My využijeme informaci o evolučně konzervovaných segmentech eukaryotických rRNA sekvencí k předpovědi sekundárních struktur. Vyvine se softwarové prostředí integrující předpovědní a vizualizační algoritmy a databázi předpovězených struktur. Předpovězené struktury se využijí k originální bioinformatické identifikaci evolučně konzervovaných strukturních motivů eukaryotických rRNA, které mohou ukázat nové aspekty role rRNA v syntéze proteinů.
Title	Nové metody pro předpověď a vizualizaci sekundárních struktur ribozomálních ribonukleových kyselin - integrované řešení Novel methods for computational prediction and visualization of secondary structures of ribosomal ribonucleic acids - an integrated solution (en)
skos:notation	GA15-00885S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA15-00885S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA15-00885S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100800862
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	IN - Informatika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	computational prediction; visualization; secondary structure; rRNA; software framework (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/15-00885S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201500001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVZ
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2017-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2015-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	Z
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	rRNA secondary structure visualization computational prediction
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-00885S/2015/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-00885S/2015/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-00885S/2016/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-00885S/2016/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-00885S/2017/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA15-00885S/2017/orjk%3A11320

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software