About: Toxic potential, evolution of toxin synthesis, and factors driving anatoxin-a production in benthic and soil nostocacean cyanobacteria

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Toxic potential, evolution of toxin synthesis, and factors driving anatoxin-a production in benthic and soil nostocacean cyanobacteria Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA14-18067S
Description	Navrhovaný projekt je zaměřen na detekci cyanotoxinových genů a evoluci syntézy toxinů v širokém spektru bentických, perifytických a půdních nostokálních sinic. Na příkladu anatoxinu-a budou studovány faktory spouštějící expresi cyanotoxinových genů (produkci cyanotoxinů), jako např. teplota, intenzita světla, koncentrace hlavních živin a proces stárnutí. Neznámé cytotoxické látky budou detekovány prostřednictvím testů cytotoxické aktivity k savčím buňkám. Vybrané cytotoxické sekundární metabolity budou izolovány, bude charakterizována jejich chemická struktura a bude vyhodnocen jejich toxický potenciál a případná využitelnost pro farmaceutické a biotechnologické účely. Celogenomové sekvenování nové generace bude provedeno u vybraných cytotoxických kmenů, což umožní bioinformatickou rekonstrukci syntetických drah nově objevených toxinů. S využitím moderních fylogenetických nástrojů a superpočítačových kapacit bude studována evoluce vybraných metabolických drah, výskyt horizontálního přenosu genů a celkové složení analyzovaných genomů. The proposed project is focused on the detection of cyanotoxin genes and evolution of toxin synthesis in a wide variety of benthic, periphytic and soil nostocacean cyanobacteria. Factors triggering cyanotoxin gene expression (cyanotoxin production), such as temperature, light intensity, macro-nutrient concentration and ageing process, will be studied on the example of anatoxin-a. Unknown cytotoxic compounds will be detected by means of testing of cytotoxic activity to mammal cells. Selected cytotoxic secondary metabolites will be isolated, their structures will be characterized and their toxic potential and possible usability for pharmaceutical and biotechnological purposes will be evaluated. Next generation genome sequencing will be performed in selected cytotoxic strains to enable bioinformatic reconstruction of new toxin synthesis pathways. Employing modern phylogenetic tools and supercomputing resources, we will address issues such as the evolution of selected metabolic pathways, the occurrence of horizontal gene transfer events, and overall composition of the genomes. (en)
Title	Toxic potential, evolution of toxin synthesis, and factors driving anatoxin-a production in benthic and soil nostocacean cyanobacteria (en) Toxický potenciál, evoluce syntézy toxinů a faktory řídící produkci anatoxinu-a u bentických a půdních nostokálních sinic
skos:notation	GA14-18067S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-18067S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-18067S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100793596
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EH - Ekologie - společenstva
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	cyanobacteria, Nostocaceae, Anabaena, Nodularia, Nostoc, Cylindrospermum, Trichormus, Wollea, cyanotoxins, toxic potential, anatoxin-a, next generation genome sequences, NRPS/PKS pathways, HPLC-MS, cytotoxicity, secondary metabolites, real-time PCR, tem… (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/14-18067S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201400001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	cyanobacteria Anabaena Cylindrospermum HPLC-MS NRPS/PKS pathways Nodularia Nostoc Nostocaceae Trichormus Wollea anatoxin-a cyanotoxins cytotoxicity next generation genome sequences real-time PCR secondary metabolites toxic potential
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	A hybrid non-ribosomal peptide/polyketide synthetase containing fatty-acyl ligase (FAAL) synthesizes the β-amino fatty acid lipopeptides puwainaphycins in the cyanobacterium Cylindrospermum alatosporum A Hybrid Non-Ribosomal Peptide/Polyketide Synthetase Containing Fatty-Acyl Ligase (FAAL) Synthesizes the beta-Amino Fatty Acid Lipopeptides Puwainaphycins in the Cyanobacterium Cylindrospermum alatosporum Nodularia (Cyanobacteria, Nostocaceae): a phylogenetically uniform genus with variable phenotypes
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-18067S/2014/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-18067S/2014/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-18067S/2015/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-18067S/2015/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-18067S/2016/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-18067S/2016/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 122 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software