About: Organizace translokačního aparátu zabývajícího se biosyntézou podjednotek fotosystému II

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Organizace translokačního aparátu zabývajícího se biosyntézou podjednotek fotosystému II Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA14-13967S
Description	Chlorofyl-vazné proteiny (PSII-CPs) jsou klíčovou strukturní komponentou fotosystému II (PSII), nicméně mechanismus jejich biosyntézy a také způsob zabudování chlorofylu zůstává nejasný. Pomocí proteinových kotev se nám podařilo izolovat velký proteinový komplex ze sinice Synechocystis 6803, který obsahuje Sec translokázu, chlorofyl syntázu a asembly faktory PSII. Očekáváme, že právě tento komplex odpovídá v buňce za produkci PSII-CPs a jeho charakterizace je primární náplní projektu. Konkrétně se zaměříme na strukturní a funkční problematiku s cílem: a) identifikovat jednotlivé proteinové podjednotky komplexu, kvantifikovat asociované pigmenty a získat strukturu komplexu s nízkým rozlišením pomocí single-particle analýzy. b) definovat funkci vybraných proteinů, jejichž přítomnost v komplexu jsem již potvrdili (PAM68, HliD, Slr1870). Na řešení projektu zapojíme široké spektrum metod jako je hmotnostní spektroskopie, 2D elektroforézy, single-particle analýzu, či izotopové značení proteinů a chlorofylu. Tyto techniky budou kombinované s využitím mutantů sinic. The key structural components of Photosystem II (PSII) are large chlorophyll-proteins (PSII-CPs), however the way they are synthesized and preloaded with chlorophylls remain unresolved. Using epitope tagging we have purified a large protein complex from the cyanobacterium Synechocystis 6803, which contains Sec translocase, ribosomes, chlorophyll synthase and PSII assembly factors. We expect this complex represents apparatus responsible for the PSII-CP synthesis and its characterization is the primary objective of this project. Particularly, structural and functional issues will be addressed: a) to identify individual protein subunits, quantify associated pigments and to obtain a low-resolution structure by single particle reconstruction. b) to define function of selected proteins (PAM68, HliD, Slr1870) already found to be components of this protein machinery. A broad spectrum of methods will be employed like mass-spectrometry, 2D gel systems, single particle analysis and protein- and chlorophyll-labelling. This will be combined with using of advanced cyanobacteria mutants. (en)
Title	Organizace translokačního aparátu zabývajícího se biosyntézou podjednotek fotosystému II Organization of translocon machinery engaged in the biosynthesis of Photosystem II (en)
skos:notation	GA14-13967S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-13967S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-13967S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100792935
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	chlorophyll-binding proteins, photosystem II subunits, translocon, cyanobacteria, chlorophyll, protein-protein interactions (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-02-21 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/14-13967S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201400001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	chlorophyll cyanobacteria photosystem II subunits translocon chlorophyll-binding proteins
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Accumulation of the Type IV prepilin triggers degradation of SecY and YidC and inhibits synthesis of Photosystem II proteins in the cyanobacterium Synechocystis PCC 6803
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-13967S/2014/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-13967S/2015/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-13967S/2016/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software