About: Evoluce holocentrických chromosomů

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Evoluce holocentrických chromosomů Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-29362S
Description	An adaptive origin of holocentric chromosomes (without localized centromere) as a defense against centromere drive will be analyzed using selection regimes acting on kinetochore proteins. To explain surprisingly negative 2C/2n correlation and extreme divergences in holocentric chromosome sizes and numbers we propose a new evolutionary mechanism of “holokinetic drive” that will be tested by the study of segregation ratio of fragmented/non-fragmented homologs in the progeny of structural heterozygotes prepared via x-irradiation. Genome size, genomic GC%, portions and rates of particular modes of karyotype evolution (aneuploidy, polyploidy, chromosomal fusion/fission and repetitive DNA proliferation/removal) will be analyzed in holocentrics (Cyperaceae+Juncaceae, Chionographideae, Cuscuta subg. Cuscuta and Grammica, Drosera) and their sister monocentric clades using flow cytometry, chromosome counting and newly developed phylogenetic algorithm. A new detection technique combining irradiation and flow cytometry will be developed for an effective screening for holocentrism in plants. (en) Adaptivní vznik holocentrických chromosomů (bez lokalizované centromery) jako obrany proti centromerickému tahu bude testován pomocí selekčních režimů působících na geny kinetochorových proteinů. K objasnění překvapivě negativní korelace 2C/2n a značné divergence velikostí a počtů holocentrických chromosomů je navržen nový evoluční mechanismus %22holokinetický tah%22, který bude testován analýzou segregace fragmentovaných/nefragmentovaných homologů v potomstvu strukturálních heterozygotů připravených rentgenovým zářením. Velikost genomu a genomický obsah GC, proporce a efektivita jednotlivých mechanismů karyotypové evoluce (aneuploidie, polyploidie, fúze/fragmentace chromosomů, proliferace/odstraňování repetitivní DNA) budou analyzovány v holocentrických (Cyperaceae+Juncaceae, Chionographideae, Cuscuta subg. Cuscuta a Grammica, Drosera) a jejich sesterských monocentrických liniích pomocí průtokové cytometrie, počítání chromosomů a nově vyvinutého fylogentického algoritmu. Bude vyvinuta nová detekční technika pro masívní skríning holocentrismu u rostlin kombinující záření a cytometrii.
Title	Evoluce holocentrických chromosomů Evolution of holocentric chromosomes (en)
skos:notation	GA13-29362S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-29362S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-29362S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100770899
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EF - Botanika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	centromere drive, chromosomal fusion/fission, Cyperaceae, flow cytometry, genome size, genomic GC content, holocentric chromosomes, holokinetic drive, Juncaceae, karyotype, meiotic drive (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-29362S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Cyperaceae Juncaceae chromosomal fusion/fission flow cytometry genome size genomic GC content holocentric chromosomes holokinetic drive karyotype centromere drive
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots Genome size and genomic GC content evolution in the miniature genome-sized family Lentibulariaceae Nutrient reserves may allow for genome size increase: evidence from comparison of geophytes and their sister non-geophytic relatives
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-29362S/2013/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-29362S/2014/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-29362S/2015/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-29362S/2016/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software