About: Fungal effectors manipulating plant defence system

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Fungal effectors manipulating plant defence system Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-26798S
Description	Plants are challenged by a diverse range of microorganisms but their robust immune system beats out the majority of attacks. Small group of microbes can suppress plant defences. They achieve suppression through the deployment of effector proteins. These molecules manipulate signalling network regulated by plant hormones. Some pathogens produce phytohormones or their functional mimics. Their secretion into host tissue results in a hormonal imbalance and activation of insufficient defence responses. The project is aimed at the role of both protein effectors and phytohormones produced by a hemibiotroph fungal pathogen Leptosphaeria maculans in interaction with its host Brassica napus. Phytohormone production by the fungus will be manipulated using RNAi strategy and involved metabolic pathways will be unravelled by an approach combining LC-MS analysis, feeding experiments with hormone precursors, inhibitors of biosynthetic enzymes and knockdown lines. Protein effectors of L. maculans will be identified using bioinformatic approach and their function will be studied using silenced lines. (en) Rostliny jsou napadány různorodými mikrobiálními patogeny, ale většinou se ubrání infekci díky svému robustnímu imunitnímu systému. Malá skupina patogenů je však schopná potlačovat obranné reakce rostlin prostřednictvím efektorových proteinů, které manipulují signálními drahami řízenými rostlinnými hormony. Některé patogeny samy tyto fytohormony produkují a ty pak v rostlinách vyvolají hormonální nerovnováhu a oslabí obrannou odezvu. Cílem projektu je studovat úlohu proteinových efektorů a fytohormonů produkovaných hemibiotrofním patogenem Leptosphaeria maculans v hostitelské rostlině Brassica napus. Produkce hormonů bude u tohoto patogenu manipulována pomocí RNAi strategie a příslušné metabolické dráhy odhaleny kombinací LC-MS analýzy, aplikací prekursorů těchto hormonů a inhibitorů jejich biosyntézy a s použitím knockdown linií. Proteinové efektory L.maculans budou identifikovány pomocí bioinformatického přístupu a jejich funkce studována u linií se zatlumenou expresí.
Title	Fungal effectors manipulating plant defence system (en) Efektory houbových patogenů manipulující obranným systémem rostlin
skos:notation	GA13-26798S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-26798S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-26798S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100770805
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	effector, stem canker, Leptosphaeria maculans, phytohormons (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-17 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-26798S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2017-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	effector Leptosphaeria maculans stem canker
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Plant hormones in defense response of Brassica napus to Sclerotinia sclerotiorum - Reassessing the role of salicylic acid in the interaction with a necrotroph The Pseudomonas type III effector HopQ1 activates cytokinin signaling and interferes with plant innate immunity
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-26798S/2013/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-26798S/2014/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-26798S/2015/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-26798S/2016/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-26798S/2017/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 11 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software